My repository of Google Colab notebooks
├── Compiled_for_Colab
│ ├── AutoDock-GPU_v1.5.3_develop
│ │ ├── 110624_Compile_ADGPU_develop.ipynb
│ │ ├── adgpu_analysis
│ │ └── autodock_gpu_128wi
│ └── AutoGird_v4.2.6
│ ├── 091624_Compile_AutoGrid.ipynb
│ └── autogrid4
├── Meeko_RTD_Examples
│ ├── 01_Reactive_Docking
│ │ ├── Meeko_RTD_01_Reactive_Docking.ipynb
│ │ └── output.zip
│ └── 02_Covalent_Docking
│ ├── Meeko_RTD_02_Tethered_Docking.ipynb
│ └── output.zip
├── README.md
├── Vina_RTD_Examples
│ ├── 01_Basic_Docking
│ │ ├── Vina_RTD_01_Basic_Docking.ipynb
│ │ └── output.zip
│ ├── 02_Flexible_Docking
│ │ ├── Vina_RTD_02_Flexible_Docking.ipynb
│ │ └── output.zip
│ ├── 03_Using_AD4SF
│ │ ├── Vina_RTD_03_Docking_with_AD4SF.ipynb
│ │ └── output.zip
│ ├── 04_RNA-Small_Molecule_Basic_Docking
│ │ ├── Vina_04_RNA_Small_Molecule_Basic_Docking.ipynb
│ │ └── output.zip
│ └── 05_Basic_Docking_with_Cofactors
│ ├── Vina_05_Basic_Docking_with_Cofactor_in_Receptor.ipynb
│ └── output.zip
└── images
└── docking_workflow.png
110624_Compile_ADGPU_develop.ipynb
Vina_RTD_01_Basic_Docking.ipynb
Vina_RTD_03_Docking_with_AD4SF.ipynb
Vina_04_RNA_Small_Molecule_Basic_Docking.ipynb
Vina_05_Basic_Docking_with_Cofactor_in_Receptor.ipynb