Fix loading image on VISUALIZE plot

[ReiHashimoto]

VISUALIZE画面でのImagePlotで表示するデータの改修。

1. Start/End Indexを指定してLOADをクリック
2. /image/{filepath:path}?start_index={start_index}&end_index={end_index}のAPI call
3. OPTINIST_DIR/input/{workspace_id}/{image_file_basename}/{image_file_basename}_{start_index}_{end_index}.jsonが生成され、レスポンスとして返される
4. Plot画面でLOADしたindexの範囲で動画再生が可能になる

上記の操作をした際に、
Inputで使用しているtiffファイルの場合は期待通りに動作している。

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outputで生成されたデータの場合、end_indexを100などにしても、10までしかデータが取得できない。
3次元のoutputの画像の場合、inputのデータ同様にindex指定で再生できるようにしたい。

主な原因は、以下の2箇所

1. 3次元の配列の場合、ImageDataのsave_jsonの処理の際にindex [:10]のデータしかjsonに保存していない
   

   barebone-studio/studio/app/common/dataclass/image.py

   Line 59 in 86a47c6

   JsonWriter.write_as_split(self.json_path, create_images_list(self.data))

   
   

   barebone-studio/studio/app/common/dataclass/utils.py

   Lines 6 to 12 in 86a47c6

   	def create_images_list(data):
   	if len(data.shape) == 2:
   	save_data = copy.deepcopy(data)
   	elif len(data.shape) == 3:
   	save_data = copy.deepcopy(data[:10])
   	else:
   	assert False, "data is error"

2. image_fileの拡張子がjsonの場合は、start_index, end_indexの設定が反映されていない。
   

   barebone-studio/studio/app/common/routers/outputs.py

   Lines 124 to 138 in 86a47c6

   	if ext in ACCEPT_TIFF_EXT:
   	filepath = join_filepath([DIRPATH.INPUT_DIR, workspace_id, filepath])
   	save_dirpath = join_filepath(
   	[
   	os.path.dirname(filepath),
   	filename,
   	]
   	)
   	json_filepath = join_filepath(
   	[save_dirpath, f"{filename}_{str(start_index)}_{str(end_index)}.json"]
   	)
   	if not os.path.exists(json_filepath):
   	save_tiff2json(filepath, save_dirpath, start_index, end_index)
   	else:
   	json_filepath = filepath

対応方針(案)

以下のような対応が予測されるが、betterな実装方法があればそちらを採用。

• ImageDataにおいて、3次元データの場合は
  • save_json→jsonファイルを保存しない
  • output_path→tiffファイルのパスにする