- Anton Van de Putte (Royal Belgian Institute for Natural Sciences, KULeuven)
- Charlène Guillaumot (ULB, Bruxelles)
- Grant Humphries (HiDef Aerial Surveying Ltd)
- Huw Griffiths (British Antarctic Survey)
- Ben Raymond (Australian Antarctic Division and the University of Tasmania)
- Ryan Reisinger (CEBC-CNRS)
- Denisse Fierro Arcos (Institute for Marine and Antarctic Studies, University of Tasmania)
- Camila Cataldo Méndez (Institute for Marine and Antarctic Studies, University of Tasmania)
El Comité Científico de Investigación Antárctica (SCAR por sus siglas en inglés) en conjunto con el proyecto rOpenSci y el Portal de Biodiversidad Antártica desarrollaron este curso corto que presenta herramientas para llevar a cabo análisis especiales y modelado utilizando el lenguaje de programación R con enfoque en el Océano del Sur.
En este curso participantes aprenderán a encontrar, descargar y limpiar datos de ocurrencia de especies presentes en el Océano del Sur utilizando librerías en en R. También aprenderán sobre modelos de distribución de especies, cómo implementarlos, y cómo crear mapas de distribución de especies en la región con proyección polar. Para esto utilizaremos R y herramientas desarrolladas por la comunidad científica antártica.
Para el final del curso, los participantes habrán aprendido a llevar a cabo las siguientes acciones con sus propios datos:
- Crear un flujo de trabajo que busque, limpie y analice datos biológicos
- Implementar modelos de distribución de especies
- Identificar los paquetes en
Rque les permitan llevar a cabo los dos punto anteriores
TBA
Se estima que el curso tiene una duración total de 5 días. La primera parte del curso (3 días) se enfoca en presentar varios paquetes en R sobre limpieza y manipulación de datos, modelaje, así como flujos de trabajo sugeridos. La segunda parte del curso (2 días) es la parte práctica donde participantes tendrán la oportunidad de utilizar sus propios datos para llevar a cabo lo aprendido en la primera parte.
Este curso es recomendado para investigadores a inicio de su carrera, así como a estudiantes, pero es también útil para investigadores más establecidos.
Experiencia programando en R es preferible, así como experiencia con el uso de sistemas de información geográfico (SIG).
Si crees que tu experiencia en R no es suficiente para cubrir este curso, te recomendamos los siguientes recursos gratuitos:
Software necesario
- La versión más reciente de
Rpara tu sistema operativo. Podrás encontrar más información en CRAN - RStudio para escrito. Puedes descargarlo desde Posit de manera gratuita
- Usuarios de Windows solamente además deberán instalar compatible con la versión de
Ren su computador. Más información en CRAN
Software opcional
- Para crear mapas y llevar a cabo análisis espaciales, recomendamos QGIS. Este software es gratuito y está disponible para varios sistemas operativos.
- Quantarctica es una collección de datos espaciales de Antártica que es compatible con QGIS.
Español
Para asegurar una experiencia segura, agradable y amigables para las personas participantes, nos adherimos a este código de conducta.
TBA
rOpenSci es una iniciativa sin fines de lucro fundada en el 2011 con el objetivo de promover reproducibilidad en el desarrollo de código para fines científicos. Además apoya y promueve una cultura que valora la investigación abierta y reproducible usando datos compartidos de manera pública y con software abierto. rOpenSci mantiene un gran número de paquetes en R, crea una infrastructura social a través de la inclusión de participantes de origines diversos, desarrolla capacidades, y defiende una cultura de datos abiertos y software reutilizable.
El Grupo de Expertos en Informático de la Biodiversidad Antártica (EG-ABI por sus siglas en inglés) tiene como objetivo fomentar la aplicación y desarrollo de informática para la biodiversidad (ciencias de la biodiversidad basada en procesos computacionales abiertos que permitan procesar información de manera eficiente) dento de la comunidad científica de la Antártida.
El Portal de Biodiversidad Antártica ofrece acceso a datos de Biodiversidad Antártica. Esta es una de las contribuciones del gobierno federal Belga a LifeWatch-ERIC: un Consorcio de Infrastructura Europea que provee infrastructura de investigación e-Science a científicos que buscan incrementar sus conocimientos y enriquecer su entendiemiento de la organización de la biodiversidad y las funciones y servicios ecosistémicos.