JUst a SEquence toolKIt for Transcriptomics
基于 Python v3.10
和 PyQt5
开发,软件打包使用 pyinstaller
进行,请在右侧 Release 下载。
JuseKit.zip
解压后使用文件夹中的 Jusekit.exe
打开。
古早版本可以直接下载 JuseKit.exe
打开,但运行速度和性能等可能有所下降。
在该 repository 的 examples
文件夹下储存着用于运行 JuseKit 的示例数据。
该软件也可直接使用源码运行,不过需要安装好已使用的包:
git clone https://github.com/JuseTiZ/JuseKit.git
cd JuseKit
python JuseKit_window.py
如果你想自行编译成 exe
文件,可以通过 pyinstaller
进行:
git clone https://github.com/JuseTiZ/JuseKit.git
cd JuseKit
pyinstaller --noconsole --name=JuseKit --icon=jusekit.ico JuseKit_window.py --hidden-import=matplotlib.backends.backend_pdf
教程可见:Juse's blog
若存在报错 Bug 可以联系 Juse 修复。
- 提取最长转录本。
- 根据 id 提取序列。
- 对序列的 id 进行各种处理。
- 串联序列并得到分区信息。
- 批量进行序列格式转换。
- 批量提取 Orthofinder 的 orthogroup 对应的 CDS 序列。
- 批量进行序列的物种数和长度过滤。
- 火山图绘制。
- 气泡图绘制。
- 组装指标计算。
目前已有的小功能:
- 学习计时器。
- 批量改后缀。