TD SIG niveau avancé - Modélisation des dynamiques spatio-temporelles des abondances des vecteurs du paludisme en Côte d'Ivoire avec le langage de programmation R
Ce document est un exercice à destination de personnes souhaitant approfondir leurs connaissances en manipulation de données spatiales et spatio-temporelles sur R. Nous abordons des notions avancées de SIG (manipulation de données d’occupation du sol, extraction de séries spatio-temporelles au format NetCDF, modélisation spatiale) à travers un cas d’étude lié à la santé publique : la modélisation des dynamiques spatio-temporelles des abondances des vecteurs du paludisme en fonction des conditions environnementales. Notre zone d’étude est la région de Korhogo, située au Nord de la Côte d'Ivoire.
Cet exercice requiert le logiciel R. Après une rapide présentation du cas d'étude théorique, nous présentons les données utilisées dans l'exercice, puis nous déroulons l'exercice. Afin de contrôler le bon avancement du tutoriel, des questions sont régulièrement posées tout au long de l'exercice. Les réponses sont disponibles en fin de document.\
Prérequis pour aborder sereinement le document : Connaissances en SIG, connaissances de base dans le langage de programmation R
Notions et concepts techniques abordés : extraction de données spatio-temporelles, séries spatio-temporelles issues d'images d'observation de la Terre, NetCDF, modélisation statistique explicative, modélisation statistique exploratoire, modélisation statistique prédictive
Nota bene : le code R présenté dans ce document n'est pas toujours nécessairement optimisé en terme de performances. A l'image du document dans son ensemble, il a une vocation avant tout pédagogique.
La ressource pédagogique est disponible aux adresses suivantes :
- html : https://ptaconet.github.io/td_anopheles_environnement/
- pdf : https://doi.org/10.5281/zenodo.7635937
Paul Taconet. (2023, février 13). TD SIG niveau avancé - Modélisation des dynamiques spatio-temporelles des abondances des vecteurs du paludisme en Côte d'Ivoire avec le langage de programmation R. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.7635937
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