diff --git a/NEWS.md b/NEWS.md index d133e84..4e2e486 100644 --- a/NEWS.md +++ b/NEWS.md @@ -1,6 +1,7 @@ # philsfmisc 0.6.5 - New template: SAP #63 +- All document templates removed #70 (all other template-related issues moved to philsf-workflow repo) # philsfmisc 0.6.4 diff --git a/README.md b/README.md index 23cf62f..be2c0a1 100644 --- a/README.md +++ b/README.md @@ -26,10 +26,3 @@ To install the *development* version, use the following command: - `cv2logsd` - `cv2logvar` - `predint` - -## Report template - -An R Markdown template is provided suitable for reports of data analyses. - -It includes a reference docx with pre-formatted styles for easy creation of professional reports, in brazilian portuguese by default. -This reference styles docx includes a template `URL` pointing to a `philsf-biostat` organization repository. diff --git a/inst/rmarkdown/templates/Relatorio/skeleton/misc/style.docx b/inst/rmarkdown/templates/Relatorio/skeleton/misc/style.docx deleted file mode 100755 index 0da9f2c..0000000 Binary files a/inst/rmarkdown/templates/Relatorio/skeleton/misc/style.docx and /dev/null differ diff --git a/inst/rmarkdown/templates/Relatorio/skeleton/skeleton.Rmd b/inst/rmarkdown/templates/Relatorio/skeleton/skeleton.Rmd deleted file mode 100644 index eec3350..0000000 --- a/inst/rmarkdown/templates/Relatorio/skeleton/skeleton.Rmd +++ /dev/null @@ -1,95 +0,0 @@ ---- -title: "Análise Estatística de ..." -author: '**De:** Felipe Figueiredo **Para:** ___' -date: '**Data: ** dd/mm/aaaa' -output: - html_document: - fig_caption: yes - fig_height: 6 - fig_width: 6 - keep_md: yes - number_sections: yes - toc: yes - pdf_document: - number_sections: yes - toc: yes - word_document: - fig_caption: yes - fig_height: 6 - fig_width: 6 - reference_docx: misc/style.docx - toc: yes -subtitle: 'RELATÓRIO: analise_dados_XX_aaaa' -toc-title: "Sumário" ---- - -```{r setup, include=FALSE} -knitr::opts_chunk$set(echo = FALSE) -knitr::opts_knit$set(root.dir = normalizePath("..")) -options(scipen = 999) -library(pander) -library(knitr) -library(philsfmisc) -``` - ---- - -**Histórico do documento** - -```{r, echo = FALSE} -Version <- c("01") -Changes <- c("Versão inicial") -history <- cbind(Version, Changes) -colnames(history) <- c("Versão", "Alterações") -# pander(history, split.cells = 70) -kable(history) -``` - ---- - -# Assinaturas - -```{r, echo=FALSE} -sig.field <- "__________________________" -date.field <- "_____________" -Stat <- c("Elaborador", "Nome", "Função", sig.field, date.field) -Reviewer <- c("Revisado por", "", "", sig.field, date.field) -Approver <- c("Verificado por", "", "", sig.field, date.field) -Final.Approver <- c("Aprovação final", "", "", sig.field, date.field) - -sigs <- rbind( - Stat - , Reviewer - , Approver - , Final.Approver - ) -rownames(sigs) <- NULL -colnames(sigs) <- c("Papel", "Nome", "Função", "Assinatura", "Data") - -# pander(sigs, split.cells = c(9, 14, 14, 16, 8), split.table = Inf) -kable(sigs) -``` - -# Lista de abreviaturas - -# Introdução - -## Objetivos - -## Recepção e tratamento dos dados - -# Metodologia - -Esta análise foi realizada utilizando-se o software `R` versão `r getRversion()`. - -# Resultados - - - -# Conclusões - - -# Referências - -# Apêndice - diff --git a/inst/rmarkdown/templates/Relatorio/template.yaml b/inst/rmarkdown/templates/Relatorio/template.yaml deleted file mode 100644 index d351ab8..0000000 --- a/inst/rmarkdown/templates/Relatorio/template.yaml +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -name: Relatorio de consultoria de Bioestatistica -description: > - Template de relatório de análise de dados de Bioestatística (philsf-biostat@github). -create_dir: false diff --git a/inst/rmarkdown/templates/SAP/skeleton/misc/style.docx b/inst/rmarkdown/templates/SAP/skeleton/misc/style.docx deleted file mode 100755 index 748cd07..0000000 Binary files a/inst/rmarkdown/templates/SAP/skeleton/misc/style.docx and /dev/null differ diff --git a/inst/rmarkdown/templates/SAP/skeleton/skeleton.Rmd b/inst/rmarkdown/templates/SAP/skeleton/skeleton.Rmd deleted file mode 100644 index d80126c..0000000 --- a/inst/rmarkdown/templates/SAP/skeleton/skeleton.Rmd +++ /dev/null @@ -1,118 +0,0 @@ ---- -title: "Plano de Análise Estatística de ..." -author: '**De:** Felipe Figueiredo **Para:** ___' -date: '**Data: ** dd/mm/aaaa' -output: - html_document: - fig_caption: yes - fig_height: 6 - fig_width: 6 - keep_md: yes - number_sections: yes - toc: yes - pdf_document: - number_sections: yes - toc: yes - word_document: - fig_caption: yes - fig_height: 6 - fig_width: 6 - reference_docx: misc/style.docx - toc: yes -subtitle: 'SAP: analise_dados_XX_aaaa' -toc-title: "Sumário" ---- - -```{r setup, include=FALSE} -knitr::opts_chunk$set(echo = FALSE) -knitr::opts_knit$set(root.dir = normalizePath("..")) -options(scipen = 999) -library(pander) -library(knitr) -library(philsfmisc) -``` - ---- - -**Histórico do documento** - -```{r, echo = FALSE} -Version <- c("01") -Changes <- c("Versão inicial") -history <- cbind(Version, Changes) -colnames(history) <- c("Versão", "Alterações") -# pander(history, split.cells = 70) -kable(history) -``` - ---- - -# Assinaturas - -```{r, echo=FALSE} -sig.field <- "__________________________" -date.field <- "_____________" -Stat <- c("Elaborador", "Nome", "Função", sig.field, date.field) -Reviewer <- c("Revisado por", "", "", sig.field, date.field) -Approver <- c("Verificado por", "", "", sig.field, date.field) -Final.Approver <- c("Aprovação final", "", "", sig.field, date.field) - -sigs <- rbind( - Stat - , Reviewer - , Approver - , Final.Approver - ) -rownames(sigs) <- NULL -colnames(sigs) <- c("Papel", "Nome", "Função", "Assinatura", "Data") - -# pander(sigs, split.cells = c(9, 14, 14, 16, 8), split.table = Inf) -kable(sigs) -``` - -# Lista de abreviaturas - -# Introdução - -## Contexto - -## Objetivos - -## Hipóteses - -# Limpeza dos dados - -# Variáveis do estudo - -## Desfechos primário e secundários - -## Covariáveis - -# Métodos estatísticos - -## Análises estatísticas - -### Análise descritiva - -### Análise inferencial - -### Modelagem estatística - -## Significância e Intervalos de Confiança - -## Tamanho da amostra e Poder - -## Softwares utilizados - -Esta análise será realizada utilizando-se o software `R` versão `r getRversion()`. - - - -# Exceções e Observações - - - -# Referências - -# Apêndice - diff --git a/inst/rmarkdown/templates/SAP/template.yaml b/inst/rmarkdown/templates/SAP/template.yaml deleted file mode 100644 index 6b60c79..0000000 --- a/inst/rmarkdown/templates/SAP/template.yaml +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -name: Plano de Análise Estatística (SAP) -description: > - Template de plano de análise estatística (SAP) (philsf-biostat@github). -create_dir: false