From 0f35191dde7ffb1c6a1560a9992d48884141b735 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: lpg-tech Date: Wed, 6 Dec 2023 22:36:13 +0100 Subject: [PATCH 1/8] review usecases-english --- input/pagecontent/usecases-english.md | 26 ++++++++++++++------------ 1 file changed, 14 insertions(+), 12 deletions(-) diff --git a/input/pagecontent/usecases-english.md b/input/pagecontent/usecases-english.md index ba276fa0..69c08d35 100644 --- a/input/pagecontent/usecases-english.md +++ b/input/pagecontent/usecases-english.md @@ -6,11 +6,14 @@ --> ### Use Case 1: Lab Order -The customer (e.g. a doctor) requires various laboratory tests for further diagnostics. He creates an order document in his Electronic Medical Records (EMR) system, which contains the administrative data structured in accordance with the CH ORF implementation guide and whose contents are available in the EMR. From the analyses provided by the LIS, he can select those that help him with his question, and he can also determine the samples corresponding to the analyses. For example, he wants to have glucose analysed in the blood and cerebrospinal fluid. The laboratory system can store the information on the required containers and any additives in the system. The pre-analytical conditions are specified. +The customer (e.g. a doctor) requires various laboratory tests for further diagnostics. He creates an order document in his Electronic Medical Records (EMR) system, which contains the administrative data structured in accordance with the CH ORF implementation guide and whose contents are available in the EMR. From the analyses provided by the LIS, he can select those that help him with his question, and he can also determine the samples corresponding to the analyses. For example, he wants to have glucose analysed in the blood and cerebrospinal fluid. The laboratory system can store the information on the required containers and any additives in the system. The pre-analytical conditions are specified. The order document is sent to the laboratory information system (LIS). He can also add information about the clinical context to the laboratory order: problem list, current medication list, questions about the prescribed analyses +Example document: + +best-practice ### Use Case 2: Lab Order by Form @@ -42,18 +45,24 @@ A form (Questionnaire) is presented to the client, which contains the following Outside of this use case: the results are then reported back to the client. -### Use Case 2: Requesting additional examinations of the same sample +Example document: + +tvt by Form + + + +### Use Case 3: Requesting additional examinations of the same sample It is not uncommon for the results of laboratory tests to lead to the request for additional tests on the same sample. In the example 1-tvt, venous thrombophilia may be suspected, so that further laboratory tests can detect hereditary causes such as factor V Leiden mutation, prothrombin gene mutation, antithrombin deficiency, etc. * Details of the requested service * ServiceRequest.category is RequestForAdditionalExam -### Use Case 3: Requesting existing lab results and images +### Use Case 4: Requesting existing lab results and images Sometimes the physician also wants information about previous laboratory tests, e.g., to assess the prostate-specific antigen (PSA) trend. -### Use Case 4: Collective request for toxicological testing (biological monitoring) +### Use Case 5: Collective request for toxicological testing (biological monitoring) This use case corresponds to example 5-biol-monit. In order to assess the exposure of workers to chemical substances, measurements at the workplace are supplemented by occupational health checkups. The toxic substances themselves or their metabolites in serum or urine can be determined. The order is initiated by the occupational physician of the company or the insurance company. The problem of employee fluctuations must be kept in mind. @@ -81,7 +90,7 @@ If this is of particular interest for the interpretation of the prescribed exami ### Use Case 7: Information on the sample, preanalytics -For certain tests, the order and sample alone are not sufficient to determine the laboratory result. In such cases, observations on the sample collection must be supplied to the laboratory. An example of this is the determination of creatinine clearance in 24 h urine. For this purpose, the laboratory must know the amount of urine collected during a certain period of time. For this purpose, the ordering party provides the laboratory with the urine volume, as well as a sample of the urine and serum. +For certain tests, the order and sample alone are not sufficient to determine the laboratory result. In such cases, observations on the sample collection must be supplied to the laboratory. An example of this is the determination of creatinine clearance in 24 h urine. For this purpose, the laboratory must know the amount of urine collected during a certain period of time. Therefore the ordering party provides the laboratory with the urine volume, as well as a sample of the urine and serum. * Collected urine quantity: Specimen.collection.quantity. @@ -97,10 +106,3 @@ For Blood gas analyses, the amount of oxygen administered to the patient is some * ServiceRequest.reasonReference (Condition | Observation | DiagnosticReport) * ServiceRequest.supportingInfo, e.g. O2 4 liters/min. - -### Use Case 9: Requesting monitoring examinations - -Laboratories often offer the option of monitoring vital functions with appropriate medical devices, such as 24-hour Blood pressure monitoring, long-term ECG monitoring, or sleep medicine monitoring. For this purpose, the medical device is either sent to the client, or the patient picks it up from the lab himself. - -* However, the procedure of including this use case in the present implementation guide seems unsatisfactory, since such monitoring investigations of vital data fall outside the actual laboratory domain, and since FHIR provides us with more specific resources: The [Device Request](https://hl7.org/fhir/R4B/devicerequest.html#DeviceRequest) resource lends itself here, with the required device referenced in the [DeviceDefinition](https://hl7.org/fhir/R4B/devicedefinition.html) resource. The corresponding use case can be implemented analogously to the laboratory regulation as a bundle with a composition, which contains the [Device Request](https://hl7.org/fhir/R4B/devicerequest.html#DeviceRequest) instead of the Service Request. It therefore makes more sense to deal with the monitoring request in a separate Implementation Guide. -Based on the above considerations, the corresponding ServiceRequestCategories for monitoring were commented out in the ValueSet of the Implementation Guide. From b0f1a2b694c6f3f34556701f5da5c07a2af481c0 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: lpg-tech Date: Wed, 6 Dec 2023 23:07:29 +0100 Subject: [PATCH 2/8] remove traces of uncomplete merging --- input/fsh/instances/practitioner/ArminAhrens.fsh | 4 ---- 1 file changed, 4 deletions(-) diff --git a/input/fsh/instances/practitioner/ArminAhrens.fsh b/input/fsh/instances/practitioner/ArminAhrens.fsh index 0b9e9b2c..faf632f6 100644 --- a/input/fsh/instances/practitioner/ArminAhrens.fsh +++ b/input/fsh/instances/practitioner/ArminAhrens.fsh @@ -1,7 +1,3 @@ -<<<<<<< HEAD -======= -// moved to 6-histopath-ServiceRequest ->>>>>>> d8dd1068ca04fbf47ccb1302bd76728d94c0e925 Instance: ArminAhrens InstanceOf: CHCorePractitioner Title: "Armin Ahrens" From 0c99533cccf5695afbc6ff79f3e6b7248cf2ffce Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: lpg-tech Date: Thu, 7 Dec 2023 01:25:13 +0100 Subject: [PATCH 3/8] review usecases and translations --- input/pagecontent/usecases-english.md | 20 ++--- input/pagecontent/usecases-french.md | 83 ++++++++------------ input/pagecontent/usecases-german.md | 104 ++++++++++++-------------- 3 files changed, 89 insertions(+), 118 deletions(-) diff --git a/input/pagecontent/usecases-english.md b/input/pagecontent/usecases-english.md index 69c08d35..6355aef5 100644 --- a/input/pagecontent/usecases-english.md +++ b/input/pagecontent/usecases-english.md @@ -49,8 +49,6 @@ Example document: tvt by Form - - ### Use Case 3: Requesting additional examinations of the same sample It is not uncommon for the results of laboratory tests to lead to the request for additional tests on the same sample. In the example 1-tvt, venous thrombophilia may be suspected, so that further laboratory tests can detect hereditary causes such as factor V Leiden mutation, prothrombin gene mutation, antithrombin deficiency, etc. @@ -58,9 +56,9 @@ It is not uncommon for the results of laboratory tests to lead to the request fo * Details of the requested service * ServiceRequest.category is RequestForAdditionalExam -### Use Case 4: Requesting existing lab results and images +### Use Case 4: Requesting existing lab results and images (out of scope) -Sometimes the physician also wants information about previous laboratory tests, e.g., to assess the prostate-specific antigen (PSA) trend. +Sometimes the physician also wants information about previous laboratory tests, e.g., to assess the prostate-specific antigen (PSA) trend. It is not covered here. ### Use Case 5: Collective request for toxicological testing (biological monitoring) @@ -76,19 +74,21 @@ Examples are: Example document: [5-biol-monit.xml](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/tree/master/input/examples/bundle/5-biol-monit.xml). Work lists are processed, which last over a longer period of time (days/weeks). Generally, specific examinations are requested on multiple patients. -### Use Case 5: Suggestion of additional or alternative examinations by the laboratory physician (order recipient, receiver) +### Use Case 6: Suggestion of additional or alternative examinations by the laboratory physician (order recipient, receiver) After the laboratory order has been received and processed, the situation may arise in which the laboratory physician wishes to make suggestions for additional or alternative examinations to the author of the order. He can use the received order document for this purpose, exchange the personal data of the sender and receiver through his information system, and send it back with the suggestions for further or alternative laboratory examinations. * ServiceRequest.category: ProposalForAdditionalExam -### Use Case 6: Findings and further data on the patient's health status +### Use Case 7: Findings and further data on the patient's health status If this is of particular interest for the interpretation of the prescribed examination, it must be possible to include further data on the patient's state of health in the laboratory order. These are existing findings, medical reports and documents. * ServiceRequest.reasonCode ServiceRequest.reasonReference -### Use Case 7: Information on the sample, preanalytics +Sample form with proposal for additional investigations for microbioligical, haematological und chemistry tests in response: [2-pertussis](http://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-2-pertussis.html). + +### Use Case 8: Information on the sample, preanalytics For certain tests, the order and sample alone are not sufficient to determine the laboratory result. In such cases, observations on the sample collection must be supplied to the laboratory. An example of this is the determination of creatinine clearance in 24 h urine. For this purpose, the laboratory must know the amount of urine collected during a certain period of time. Therefore the ordering party provides the laboratory with the urine volume, as well as a sample of the urine and serum. @@ -98,11 +98,11 @@ For certain tests, the order and sample alone are not sufficient to determine th Another example is the Synacthen(ACTH) function test, where a basal Blood sample is collected in the morning fasting, followed immediately by the Synacthen injection, and a second Blood sample is collected an hour later. -* Basal serum sample fasting and administration of Synacthen(ACTH): Specimen.collection.collected[collectedDateTime], a second serum sample is collected 60 minutes later: Specimen.collection.collected[collectedDateTime] +* Basal serum sample fasting and administration of Synacthen(ACTH): Specimen.collection.collected[collectedDateTime], a second sample is collected 60 minutes later: Specimen.collection.collected[collectedDateTime] -### Use Case 8: Additional information on the context of the sample +### Use Case 9: Additional information on the context of the sample -For Blood gas analyses, the amount of oxygen administered to the patient is sometimes of concern +For Blood gas analyses, the amount of oxygen administered to the patient is of concern * ServiceRequest.reasonReference (Condition | Observation | DiagnosticReport) * ServiceRequest.supportingInfo, e.g. O2 4 liters/min. diff --git a/input/pagecontent/usecases-french.md b/input/pagecontent/usecases-french.md index d73f73e6..3664af49 100644 --- a/input/pagecontent/usecases-french.md +++ b/input/pagecontent/usecases-french.md @@ -6,7 +6,17 @@ ╰───────────────────────────────────────────────────────────╯ --> -### Cas d'utilisation 1: Résultats des Tests au sens classique du terme +### Cas d'utilisation 1: Commande de laboratoire + +Le client (par exemple, un médecin) nécessite divers examens de laboratoire pour des diagnostics ultérieurs. Il crée un document de commande dans son système d'enregistrement médical électronique (EMR), qui contient les données administratives structurées conformément au guide de mise en œuvre CH ORF et dont le contenu est disponible dans l'EMR. À partir des analyses fournies par le LIS, il peut sélectionner celles qui l'aident dans sa question, et il peut également déterminer les échantillons correspondant aux analyses. Par exemple, il souhaite faire analyser la glycémie dans le sang et le liquide céphalorachidien. Le système de laboratoire peut stocker les informations sur les contenants nécessaires et les éventuels additifs dans le système. Les conditions préanalytiques sont spécifiées. Le document de commande est envoyé au système d'information de laboratoire (LIS). + +Il peut également ajouter des informations sur le contexte clinique à la commande de laboratoire : liste des problèmes, liste des médicaments en cours, questions sur les analyses prescrites. + +Document d'exemple : + +Meilleure pratique + +### Cas d'utilisation 2: Laboratoire Commande par Formulaire Le donneur d'ordre (par ex. le médecin) a besoin de différents examens de laboratoire pour la suite du diagnostic. Pour ce faire, il crée dans le système d'information de son cabinet un document de commande contenant les informations nécessaires sur le patient, le test de laboratoire, les échantillons, etc. Les échantillons nécessaires (sérum, urine, liquide céphalorachidien) sont collectés dans des récipients correspondants et clairement attribués au document de commande (Specimen.identifier, Specimen.container.identifier). Les échantillons peuvent être analysés dans le laboratoire de l'entreprise ou doivent être envoyés par courrier ou par coursier au laboratoire externe. Le système d'information du laboratoire leur attribue alors un identifiant propre (Specimen.accessionIdentifier). @@ -36,93 +46,62 @@ Un formulaire (Questionnaire) est présenté au donneur d'ordre, qui contient le En dehors de ce cas d'utilisation : les résultats sont ensuite communiqués au donneur d'ordre. -Exemple de formulaire pour l'hématologie, la coagulation et la chimie clinique : [1-tvt](http://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-1-tvt-by-form.html). -Exemple de formulaire pour la microbiologie, l'hématologie et la chimie clinique : [2-pertussis](http://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-2-pertussis.html). - -### Cas d'utilisation 2: Prescription de laboratoire sans utilisation de Questionnaire et QuestionnaireResponse - -Dans le cas de la prescription de laboratoire interne (prescription à partir du SIH vers le système de laboratoire au sein du même hôpital), les systèmes de prescription de laboratoire propres avec CDS connecté jouent un rôle essentiel, de sorte qu'il doit être possible de représenter les prescriptions de laboratoire sans questionnaire. Afin de pouvoir prescrire plusieurs analyses pour le même échantillon, plusieurs demandes de service doivent pouvoir être représentées au moyen de 'Request Pattern'. -Exemple de formulaire sans Q/QR +tvt par Formulaire ### Cas d'utilisation 3: Demande d'analyses supplémentaires du même échantillon Il n'est pas rare que les résultats d'examens de laboratoire conduisent à demander d'autres tests sur le même échantillon. Ainsi, dans l'exemple 1-tvt, une thrombophilie veineuse peut être suspectée, de sorte que d'autres examens de laboratoire peuvent trouver des causes héréditaires telles que la mutation du facteur V de Leiden, la mutation du gène de la prothrombine, le déficit en antithrombine, etc. * Informations sur le service demandé -* Dans le ValueSet Servicerequest.category, RequestForAdditionalExam est sélectionné. + * Dans le ValueSet Servicerequest.category, RequestForAdditionalExam est sélectionné. ### Cas d'utilisation 4: Demande de résultats de laboratoire et d'images existants -Parfois, le médecin souhaite également obtenir des informations sur des examens de laboratoire antérieurs, par exemple pour évaluer l'évolution de l'antigène spécifique de la prostate (PSA). - -* Données relatives au service demandé -* La catégorie Servicerequest.category est RequestForPrecedentReport ou RequestForPrecedentReportAndImages. - -Exemple de formulaire avec ServiceRequestCategory RequestForPrecedentReport +Parfois, le médecin souhaite également obtenir des informations sur les analyses de laboratoire antérieures, par exemple pour évaluer la tendance de l'antigène prostatique spécifique (PSA). Cette question n'est pas abordée ici. -### Cas d'utilisation 5: Ordre de collecte pour les analyses toxicologiques (surveillance biologique) +### Cas d'utilisation 5: Demande collective d'essais toxicologiques (surveillance biologique) Ce cas d'utilisation correspond à l'exemple 5-biol-monit. Pour évaluer l'exposition des travailleurs aux substances chimiques, des mesures sur le lieu de travail sont complétées par des examens préventifs de la médecine du travail. Il est possible de déterminer les agents toxiques eux-mêmes ou leurs métabolites dans le sérum ou l'urine. La demande est lancée par le médecin du travail de l'entreprise ou de l'assurance. Il faut garder à l'esprit la problématique des fluctuations du personnel. En voici quelques exemples : * Médecine du travail : commande d'analyses de laboratoire pour un groupe d'ouvriers. -* ServiceRequest.subject fait référence à un groupe -* ServiceRequest.specimen fait référence à plusieurs échantillons (0 .. *) + * ServiceRequest.subject fait référence à un groupe + * ServiceRequest.specimen fait référence à plusieurs échantillons (0 .. *) * Industrie alimentaire : enquête sur l'hygiène des employés (p.ex. contamination par salmonelles) * Enquêtes de police Exemple de formulaire : [5-biol-monit](http://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-5-biol-monit.html). Des listes de travail sont traitées, qui s'étendent sur une longue période (jours/semaines). En règle générale, certains examens sont demandés pour plusieurs patients. -### Cas d'utilisation 6: Proposition d'examens supplémentaires ou alternatifs par le médecin de laboratoire (destinataire de la commande, receiver) +### Cas d'utilisation 6: Suggestion d'examens supplémentaires ou alternatifs par le médecin de laboratoire (destinataire de l'ordonnance) -Après réception et traitement du mandat de laboratoire, il peut arriver que le médecin de laboratoire souhaite proposer à l'auteur du mandat des examens supplémentaires ou alternatifs. Pour ce faire, il peut utiliser le document de commande reçu, échanger par son système d'information les données personnelles de l'émetteur et du récepteur, et le renvoyer avec les propositions d'examens de laboratoire supplémentaires ou alternatifs. +Après réception et traitement de l'ordonnance du laboratoire, il peut arriver que le médecin du laboratoire souhaite suggérer à l'auteur de l'ordonnance des examens complémentaires ou alternatifs. Il peut utiliser le document de commande reçu à cette fin, échanger les données personnelles de l'expéditeur et du destinataire par l'intermédiaire de son système d'information et le renvoyer avec les suggestions d'examens de laboratoire supplémentaires ou alternatifs. * ServiceRequest.category : ProposalForAdditionalExam -Exemple de formulaire pour la microbiologie, l'hématologie et la chimie clinique : [2-pertussis](http://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-2-pertussis.html). -Exemple de formulaire avec proposition d'examens complémentaires en réponse - -### Cas d'utilisation 7: Problématique, résultats et autres données sur l'état de santé du patient +### Cas d'utilisation 7: Constatations et données complémentaires sur l'état de santé du patient -La question posée est particulièrement intéressante pour la demande du laboratoire. Le ServiceRequest.reasonCode met à disposition le champ nécessaire à cet effet. Le motif de la demande (ReasonCode) peut être codé, par exemple sous la forme d'une procédure SNOMED-CT ; un texte libre pur est également possible, par exemple 'Examen d'une pneumonie adypique'. Si cela présente un intérêt particulier pour l'interprétation de l'examen prescrit, d'autres données relatives à l'état de santé du patient peuvent être incluses dans la demande de laboratoire, telles que les résultats existants, les rapports médicaux et les documents. +Si cela présente un intérêt particulier pour l'interprétation de l'examen prescrit, il doit être possible d'inclure d'autres données sur l'état de santé du patient dans la commande du laboratoire. Il s'agit de résultats existants, de rapports médicaux et de documents. -* ServiceRequest.reasonCode ServiceRequest.reasonCode.text +* ServiceRequest.reasonCode ServiceRequest.reasonReference -Exemple de formulaire pour la microbiologie avec question [4-sepsis](http://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-4-sepsis.html). +Exemple de formulaire avec proposition d'investigations supplémentaires pour des tests microbiologiques, hématologiques et chimiques en réponse : [2-pertussis] (). -### Cas d'utilisation 8: Indications sur l'échantillon, préanalytique +### Cas d'utilisation 8: Informations sur l'échantillon, pré-analytique -Il existe des indications obligatoires ou souhaitées pour l'établissement complet de la demande ou pour l'interprétation des résultats, car pour certaines analyses, la demande et l'échantillon ne suffisent pas à eux seuls pour déterminer le résultat du laboratoire. Dans de tels cas, des observations relatives au prélèvement d'échantillons doivent être fournies au laboratoire. Citons par exemple la détermination de la clairance de la créatinine dans l'urine de 24 heures. Pour cela, le laboratoire doit connaître la quantité d'urine collectée pendant une période donnée. Pour ce faire, le donneur d'ordre transmet au laboratoire le volume d'urine ainsi qu'un échantillon d'urine et de sérum. +Pour certains tests, la commande et l'échantillon ne suffisent pas à déterminer le résultat du laboratoire. Dans ce cas, des observations sur le prélèvement de l'échantillon doivent être fournies au laboratoire. La détermination de la clairance de la créatinine dans les urines de 24 heures en est un exemple. À cette fin, le laboratoire doit connaître la quantité d'urine collectée au cours d'une certaine période. Le donneur d'ordre fournit donc au laboratoire le volume d'urine, ainsi qu'un échantillon d'urine et de sérum. * Quantité d'urine collectée : Specimen.collection.quantity. * Début et fin de la collecte d'urine : Specimen.collection.collected[collectedPeriod] - start - end -Un autre exemple est le test de fonction Synacthène(ACTH), dans lequel un échantillon de sang basal est prélevé le matin à jeun, puis le Synacthène est immédiatement injecté, et un deuxième échantillon de sang est prélevé une heure plus tard. - -* Échantillon de sérum de base à jeun et administration de Synacthé : Specimen.collection.collected[collectedDateTime] - -* Deuxième échantillon de sérum 60 minutes plus tard : Specimen.collection.collected[collectedDateTime]. - -Ou bien des indications supplémentaires sur le contexte de l'échantillon sont souhaitées pour une interprétation ultérieure des résultats, comme par ex. -pour les analyses de gaz du sang, où la quantité d'oxygène administrée au patient au moment du prélèvement doit être connue. - -* ServiceRequest.supportingInfo, p.ex. O2 4 litres/min. - -### Cas d'utilisation 9: Demander des examens de monitorage (non recommandé) - -Les laboratoires offrent souvent la possibilité de surveiller les fonctions vitales à l'aide d'appareils médicaux appropriés, comme par exemple la surveillance de la tension artérielle 24 heures sur 24, la surveillance à long terme de l'ECG ou la surveillance médicale du sommeil. Pour ce faire, l'appareil médical est soit envoyé au prescripteur, soit le patient vient le chercher lui-même au laboratoire. On a essayé de représenter ces prescriptions par les ServiceRequest.catogories : - -* La démarche consistant à inclure ce cas d'utilisation dans le présent guide d'implémentation semble toutefois insatisfaisante, car de tels examens de surveillance des données vitales sortent du domaine du laboratoire proprement dit et parce que FHIR met à notre disposition des ressources plus spécifiques : La ressource [Device Request](https://hl7.org/fhir/R4B/devicerequest.html#DeviceRequest) s'impose ici, l'appareil nécessaire étant référencé dans la ressource [DeviceDefinition](https://hl7.org/fhir/R4B/devicedefinition.html). Le cas d'utilisation correspondant peut être implémenté de manière analogue à la prescription de laboratoire sous forme de bundle avec une composition qui contient la [Device Request](https://hl7.org/fhir/R4B/devicerequest.html#DeviceRequest) à la place de la demande de service. Il est donc plus judicieux de traiter la demande d'examens de surveillance dans un guide d'implémentation séparé. -En raison des considérations ci-dessus, les ServiceRequestCategories correspondantes pour le monitoring ont été commentées dans le ValueSet du guide d'implémentation. +Un autre exemple est le test de fonction Synacthène (ACTH), où un échantillon de sang basal est prélevé le matin à jeun, suivi immédiatement par l'injection de Synacthène, et un second échantillon de sang est prélevé une heure plus tard. -### Cas d'utilisation 10: Ordonnance de laboratoire du catalogue de laboratoire +* Échantillon de sérum basal à jeun et administration de Synacthène (ACTH) : Specimen.collection.collected[collectedDateTime], un second échantillon est prélevé 60 minutes plus tard : Specimen.collection.collected[collectedDateTime] -Ce cas d'utilisation n'entre pas dans le cadre de ce guide d'implémentation, bien qu'il constitue un élément essentiel de toute ordonnance de laboratoire. Les donneurs d'ordre ont besoin d'une sélection d'examens de laboratoire que le laboratoire peut réellement mettre à disposition. En outre, ils ont besoin d'être guidés dans la multitude d'examens possibles dans les différents domaines, ainsi que de directives pour la procédure préanalytique, de directives pour les récipients et les moyens de transport appropriés, pour les volumes minimaux des échantillons, etc. Une version future devrait offrir cette possibilité. +### Cas d'utilisation 9: Informations complémentaires sur le contexte de l'échantillon -Les laboratoires mettent à la disposition de leurs clients un catalogue des examens de laboratoire qu'ils peuvent mettre à disposition. Il peut s'agir d'examens individuels, comme la concentration de sodium dans le sérum, ou d'une collection d'examens, comme Na, K et Cl dans le sérum. Souvent sous la forme d'un manuel de laboratoire, ils rendent accessibles les consignes concernant la température de transport, la quantité minimale d'échantillons, le type de récipient de transport, etc. +Pour les analyses des gaz du sang, la quantité d'oxygène administrée au patient est un sujet de préoccupation. -Il y aura différents types d'entrées dans le catalogue (CatalogEntries) : Analyses individuelles, analyses multiples (panels), récipients d'échantillons, conditions préalables pré-analytiques. -L'enregistrement individuel d'une analyse de laboratoire ou d'un échantillon peut être représenté au moyen de la ressource CatalogEntry. Une composition avec un Profile for Catalog est alors le document qui représente le catalogue et représente l'ensemble des CatalogEntries qu'il contient. Il est important que le Catalog corresponde toujours aux conditions actuelles du laboratoire et qu'il puisse par exemple intégrer immédiatement de nouveaux examens de laboratoire ou des prescriptions modifiées de la préanalytique. -[StructureDefinition:Catalog](http://hl7.org/fhir/catalog.html) +* ServiceRequest.reasonReference (Condition | Observation | DiagnosticReport) +* ServiceRequest.supportingInfo, par exemple O2 4 litres/min. diff --git a/input/pagecontent/usecases-german.md b/input/pagecontent/usecases-german.md index a5e26d4a..d1c28dae 100644 --- a/input/pagecontent/usecases-german.md +++ b/input/pagecontent/usecases-german.md @@ -5,55 +5,57 @@ │ UC - english is original, this is a traduction │ ╰───────────────────────────────────────────────────────────╯ --> -### Use Case 1: Auftrag im herkömmlichen Sinne, analog Papierformular +### Use Case 1: Labor-Auftrag -Der Auftraggeber (z.B. Arzt) benötigt für die weitere Diagnostik verschiedene Labor-Untersuchungen. Dazu erstellt und speichert er in seinem Praxisinformationssystem ein Auftragsdokument mit den nötigen Angaben zu Patient, Labor-Test, Proben usw. Das notwendige Probenmaterial (Serum, Urin, Liquor) wird in entsprechenden Behältern gesammelt und dem Auftragsdokument eindeutig zugeordnet (Specimen.identifier, Specimen.container.identifier). Proben können im eigenen Labor untersucht werden, oder sie müssen via Post oder Kurier ins externe Labor verschickt werden. Dort weist ihnen das Laborinformationssystem einen eigenen Identifier (Specimen.accessionIdentifier) zu. Innerhalb einer Spitalinfrastruktur kann auf diese Zuweisung (relabelling) verzichtet werden, indem das Auftragsystem, die Proben-Entnahmestelle und das Laborinformationssystem denselben Identifier verwenden. +Der Auftraggeber (zum Beispiel ein Arzt) benötigt verschiedene Laboruntersuchungen für weitere Diagnosen. Er erstellt ein Bestelldokument in seinem elektronischen Patientenakten (EMR)-System, das die administrativen Daten gemäß dem CH ORF Implementierungsleitfaden strukturiert enthält und dessen Inhalt im EMR verfügbar ist. Aus den Analysen, die vom LIS bereitgestellt werden, kann er diejenigen auswählen, die ihm bei seiner Fragestellung helfen, und er kann auch die Proben bestimmen, die den Analysen entsprechen. Zum Beispiel möchte er Glukose im Blut und Liquor analysieren lassen. Das Laborsystem kann die Informationen zu den erforderlichen Behältern und eventuellen Zusätzen im System speichern. Die präanalytischen Bedingungen sind festgelegt. Das Bestelldokument wird an das Laborinformationssystem (LIS) gesendet. -Dem Auftraggeber wird ein Formular (Questionnaire) präsentiert, das folgende Angaben enthält: +Er kann auch Informationen zum klinischen Kontext der Laborbestellung hinzufügen: Problemliste, aktuelle Medikamentenliste, Fragen zu den verordneten Analysen. -* Metadaten des Auftrages -* Angaben zum Auftrag (order) -* Angaben zum zum Auftragsempfänger (receiver) -* Angaben zum Patienten -* Angaben zum Auftraggeber (sender) -* Angaben zu allfälligen Empfängern einer Resultate-Kopie (receiverCopies) -* Angaben zur Labor-Sparte (lab specialty) -* Angaben zu den verlangten Untersuchungen +Beispielformular: +best-practice -* Angaben zum Probenmaterial,Specimen - * Type: zum Beispiel Serum, Vollblut, Liquor - * Subject:Verweis auf den Patienten - * Collection: Angaben zur Entnahme, Entnahme-Zeitpunkt, Menge, Methode, Entnahmestelle (z.B. rechter Arm), Nüchternperiode - * Container: Behälter, Gefäss: Identifier, Type - * und anderes mehr +### Use Case 2: Laborverordnung unter Verwendung von Questionnaire und QuestionnaireResponse -* Angaben zum angeforderten Service - * Servicerequest.category ist RequestForLabExam - * Fragestellung, Untersuchungsgrund (ServiceRequest.reasonCode, ServiceRequest.reasonReference) - * Kostenträger (Krankenkasse, Unfallversicherung usw.) - * und anderes mehr +Der Auftraggeber (zum Beispiel ein Arzt) benötigt verschiedene Laboruntersuchungen für weitere Diagnosen. Hierfür erstellt er ein Bestelldokument in seinem Praxisinformationssystem mit den erforderlichen Informationen zum Patienten, Laboruntersuchung, Proben, etc. Das notwendige Probenmaterial (Serum, Urin, Liquor, etc.) wird in den entsprechenden Bestelldokumenten gespeichert. Das erforderliche Probenmaterial (Serum, Urin, Liquor) wird in geeigneten Behältern gesammelt und eindeutig dem Bestelldokument zugeordnet (Specimen.identifier, Specimen.container.identifier). Proben können im eigenen Labor untersucht werden, oder sie müssen per Post oder Kurier an das externe Labor geschickt werden. Dort weist das Laborinformationssystem ihnen eine eigene Kennung zu (Specimen.accessionIdentifier). -Beispielformular für Hämatologie, Koagulation und Klinische Chemie: [1-tvt](http://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-1-tvt-by-form.html). -Beispielformular für Mikrobiologie, Hämatologie und Klinische Chemie: [2-pertussis](http://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-2-pertussis.html). +Dem Kunden wird ein Formular (Fragebogen) vorgelegt, das folgende Informationen enthält: -### Use Case 2: Laborverordnung ohne Verwendung von Questionnaire und QuestionnaireResponse +* Metadaten der Bestellung +* Informationen zur Bestellung +* Informationen zum Empfänger der Bestellung +* Informationen zum Patienten +* Informationen zum Besteller (Absender) +* Details zu Empfängern einer Kopie der Ergebnisse +* Details zur Laborspezialität +* Informationen zu den angeforderten Untersuchungen -Bei der Inhouse Laborverordnung (Verordnung aus den KIS ins Laborsystem innerhalb desselben Spitals) spielen eigene Laborverordnungssysteme mit angebundenem CDS eine wesentliche Rolle, sodass die Möglichkeit bestehen muss, Laborverordnungen ohne Questionnaire abzubilden. Um mehrere Analysen für dieselbe Probe verordnet werden können, sollen mehrere Service Requests mittels 'Request Pattern' dargestellt werden können. +* Informationen zum Probenmaterial, Specimen + * Typ: z.B. Serum, Vollblut, Liquor + * Subjekt: Verweis auf den Patienten + * Sammlung: Informationen zur Sammlung, Sammelzeit, Menge, Methode, Sammelort (z.B. rechter Arm), Nüchternzeit + * Behälter, Gefäß: Kennung, Typ und mehr - +* Informationen zum angeforderten Service + * Kategorie des Serviceantrags ist RequestForLabExam + * Frage, Grund für die Untersuchung (ServiceRequest.reasonCode, ServiceRequest.reasonReference) + * Zahlungspflichtiger (Krankenversicherung, Unfallversicherung, etc.) und mehr + +Außerhalb dieses Anwendungsfalls: Die Ergebnisse werden dann dem Kunden zurückgemeldet. + +Beispiel-Dokument: + +tvt by Form ### Use Case 3: Anfordern von zusätzlichen Untersuchungen der gleichen Probe Nicht selten führen Resultate von Laboruntersuchungen dazu, dass noch weitere Test mit der gleichen Probe gewünscht werden. So kann im Beispiel 1-tvt eine venöse Thrombophilie vermutet werden, sodass weitere Laboruntersuchungen hereditäre Ursachen, wie Faktor-V-Leiden-Mutaion, Prothrombin-Genmutation, Antithrombinmangel usw. auffinden können. * Angaben zum angeforderten Service -* Im ValueSet Servicerequest.category wird RequestForAdditionalExam angewählt + * Im ValueSet Servicerequest.category wird RequestForAdditionalExam angewählt -### Use Case 4: Anfordern von vorhandenen Laborresultaten und Bildern (out of scope) +### Use Case 4: Anfordern von vorhandenen Laborresultaten und Bildern (nicht behandelt) -Dieser Use Case, der durchaus für den Laborauftrag relevant sein kann, muss über eine HTTP Abfrage beim Repository der Laborresultate angefordert werden. Er wird hier nicht behandelt. +Manchmal möchte der Arzt auch Informationen über frühere Laboruntersuchungen, z. B. zur Beurteilung des Trends des prostataspezifischen Antigens (PSA). Dies wird hier nicht behandelt. ### Use Case 5: Sammelauftrag für toxikologische Untersuchungen (biologisches Monitoring) @@ -62,8 +64,8 @@ Dieser Use Case entspricht dem Beispiel 5-biol-monit. Um die Gefährdung von Arb Beispiele dazu sind: * Arbeitsmedizin: Bestellung von Laboruntersuchungen zu einer Arbeitergruppe -* ServiceRequest.subject referenziet auf eine Gruppe -* ServiceRequest.specimen referenziert auf mehrere Proben (0 .. *) + * ServiceRequest.subject referenziet auf eine Gruppe + * ServiceRequest.specimen referenziert auf mehrere Proben (0 .. *) * Lebensmittelindustrie: Untersuchung zu Mitarbeiterhygiene (z.B. Salmonellen-Kontaminierung) * Polizeiliche Untersuchungen @@ -78,39 +80,29 @@ Nach Erhalt des Laborauftrages und dessen Bearbeitung kann sich die Situation er Beispielformular für Mikrobiologie, Hämatologie und Klinische Chemie: [2-pertussis](http://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-2-pertussis.html). Beispielformular mit Vorschlag für zusätzliche Untersuchungen als Antwort -### Use Case 7: Fragestellung, Befunde und weiteren Daten zum Gesundheitszustand des Patienten +### Use Case 7: Befunde und weitere Daten zum Gesundheitszustand des Patienten -Die Fragestellung ist für den Laborauftrag von besonderem Interesse. Dazu stellt die der ServiceRequest.reasonCode das nötige Feld zur Verfügung. Der Grund für den Auftrag (ReasonCode) kann codiert, z.B. als SNOMED-CT Procedure dargestellt werden; auch ist reiner Freitext möglich, z.B. 'Abklärung einer atypischen Pneumonie'. Wenn es für die Interpretation der verordneten Untersuchung von besonderem Interesse ist, können weitere Daten zum Gesundheitszustand des Patienten im Laborauftrag aufgenommen werden können, wie vorhandene Befunde, medizische Berichte und Dokumente. +Wenn dies für die Interpretation der verordneten Untersuchung von besonderem Interesse ist, muss es möglich sein, weitere Daten zum Gesundheitszustand des Patienten in den Laborauftrag aufzunehmen. Dies sind vorhandene Befunde, medizinische Berichte und Dokumente. -* ServiceRequest.reasonCode ServiceRequest.reasonCode.text +* ServiceRequest.reasonCode ServiceRequest.reasonReference -Beispielformular für Mikrobiologie mit Fragestellung [4-sepsis](http://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-4-sepsis.html). +Musterformular mit Vorschlag für zusätzliche Untersuchungen für mikrobiologische, hämatologische und chemische Tests als Antwort: [2-Pertussis](http://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-2-pertussis.html). -### Use Case 8: Angaben zur Probe, Präanalytik +### Use Case 8: Informationen über die Probe, Präanalytik -Es gibt zwingende oder gewünschte Angaben zur vollständigen Auftragsstellung bzw. für die Ergebnisinterpretation, da bei gewissen Untersuchungen Auftrag und Probe alleine nicht ausreichen, um das Laborresultat zu bestimmen. In solchen Fällen müssen Beobachtungen zur Probenentnahme an das Labor geliefert werden. Als Beispiel sei hier die Bestimmung der Creatinin-Clearance im 24 h Urin erwähnt. Dazu muss dem Labor die während einer bestimmten Zeitdauer gesammelte Urinmenge bekannt sein. Der Auftraggeben übermittelt dazu dem Labor das Urinvolumen, sowie eine Probe des Urins und des Serums. +Bei bestimmten Tests reichen der Auftrag und die Probe allein nicht aus, um das Laborergebnis zu ermitteln. In solchen Fällen müssen dem Labor Beobachtungen zur Probenentnahme mitgeteilt werden. Ein Beispiel hierfür ist die Bestimmung der Kreatinin-Clearance im 24-Stunden-Urin. Hierfür muss das Labor die in einem bestimmten Zeitraum gesammelte Urinmenge kennen. Deshalb stellt der Auftraggeber dem Labor die Urinmenge sowie eine Urin- und Serumprobe zur Verfügung. * Gesammelte Urinmenge: Specimen.collection.quantity. * Beginn und Ende der Urinsammlung: Specimen.collection.collected[collectedPeriod] - start - end -Ein weiteres Beispiel ist der Synacthen(ACTH) Funktionstest, bei dem eine basale Blutprobe am morgen nüchtern abgenommen wird, danach sofort das Synacthen gespritzt wird, und eine Stunde später eine zweite Blutprobe entnommen wird. - -* Basale Serum-Probe nüchtern und Verabreichen von Synacthen: Specimen.collection.collected[collectedDateTime] - -* Zweite Serum-Probe 60 Minuten später: Specimen.collection.collected[collectedDateTime] - -Oder es sind zusätzliche Angaben zum Kontext der Probe zur späteren Befundinterpretation gewünscht, wie z.Bsp. -bei Blutgas-Analysen, wo die dem Patienten zum Zeitpunkt der Probeentnahme verabreichte Sauerstoffmenge bekannt sein soll. - -* ServiceRequest.supportingInfo, z.Bsp. O2 4 Liter/Min. +Ein weiteres Beispiel ist der Synacthen(ACTH)-Funktionstest, bei dem morgens nüchtern eine Basalblutprobe entnommen wird, unmittelbar danach die Synacthen-Injektion erfolgt und eine Stunde später eine zweite Blutprobe entnommen wird. -### Use Case 9: Laborverordnung aus dem Labor-Katalog +* Basisserumprobe nüchtern und Verabreichung von Synacthen(ACTH): Specimen.collection.collected[collectedDateTime], eine zweite Probe wird 60 Minuten später entnommen: Specimen.collection.collected[collectedDateTime] -Dieser Use Case bewegt sich ausserhalb des Bereiches dieses Implementationsguides, obschon er ein wesentlicher Bestandteil von jeder Laborverordnunbg darstellt. Auftraggeber brauchen die Auswahl der Laboruntersuchungen, die das Labor auch wirklich zur Verfügung stellen kann. Ausserdem brauchen sie Orientierung in der Vielzahl von möglichen Untersuchungen in den verschiedenen Sparten, sowie Vorgaben für das präanalytische Vorgehen, Vorgaben für die richtigen Gefässe und Transportmedien, für die Minimalvolumen der Proben usw. Eine zukünftigen Version sollte diese Möglichkeit bieten. +### Use Case 9: Zusätzliche Informationen über den Kontext der Probe -Die Labore stellen dazu ihren Kunden einen Katalog von derjenigen Laboruntersuchungen zu Verfügung, welche sie zur Verfügung stellen können. Dabei kann es sich um Einzeluntersuchungen handeln, wie zum Beispiel Natriumkonzentration im Serum, oder um eine Kollektion von Untersuchungen (Panel), wie zum Beispiel Na, K und Cl im Serum handeln. Häufig in Form eines Labor-Kompendium machen sie die Vorgaben zu Transport-Temperatur, minimale Probenmenge, Art des Transportgefässes usw. zugänglich. +Bei Blutgasanalysen ist die Menge des dem Patienten verabreichten Sauerstoffs von Bedeutung -Es wird dazu verschiedene Typen von Katalogeinträgen (CatalogEntries) geben: Einzel-Analysen, Mehrfach-Analysen (panels), Proben-Gefässe, präanalytische Vorbedingungen. -Der einzelne Datensatz einer Laboruntersuchung oder einer Probe lässt sich als mittels der Resource CatalogEntry abbilden. Eine Composition mit einem Profile for Catalog ist dann das Dokument, das den Katalog darstellt und repräsentiert die Gesamtheit der enthaltenen CatalogEntries. Dabei ist wichtig, dass der Catalog immer den aktuellen Gegebenheiten des Labors entspricht, und beispielsweise sofort neue Laboruntersuchungen oder veränderte Vorgaben der Präanalytik aufnehmen kann. -[Order Catalog Implementation Guide](https://build.fhir.org/ig/HL7/fhir-order-catalog/) +* ServiceRequest.reasonReference (Zustand | Beobachtung | DiagnosticReport) +* ServiceRequest.supportingInfo, z.B. O2 4 Liter/min. From 28fa34eb40b8e2a9cabaf608fe4717c5be55663c Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: lpg-tech Date: Thu, 7 Dec 2023 01:42:16 +0100 Subject: [PATCH 4/8] rm all casestudy files --- input/pagecontent/case-study-document.md | 3 - input/pagecontent/casestudies-english.md | 88 ------------------------ input/pagecontent/casestudies-french.md | 86 ----------------------- input/pagecontent/casestudies-german.md | 85 ----------------------- 4 files changed, 262 deletions(-) delete mode 100644 input/pagecontent/case-study-document.md delete mode 100644 input/pagecontent/casestudies-english.md delete mode 100644 input/pagecontent/casestudies-french.md delete mode 100644 input/pagecontent/casestudies-german.md diff --git a/input/pagecontent/case-study-document.md b/input/pagecontent/case-study-document.md deleted file mode 100644 index 116f5e3f..00000000 --- a/input/pagecontent/case-study-document.md +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ - - -### FHIR document (Bundle) diff --git a/input/pagecontent/casestudies-english.md b/input/pagecontent/casestudies-english.md deleted file mode 100644 index 0b24acb9..00000000 --- a/input/pagecontent/casestudies-english.md +++ /dev/null @@ -1,88 +0,0 @@ - - -### Case study 1: Suspicion of deep vein thrombosis - -A patient, Tomas Timmermann, presents to Dr. med. Marc Mustermann at the Olten group practice on 09.03.2016. He verbally identifies himself via his master data as Tomas Timmermann, 01.01.1984. He reports unclear leg pain in the left lower leg as well as simultaneously occurring respiratory pain and cough. The doctor carries out the anamnesis and physical examination and prescribes the following laboratory parameters: - -* Blood cell count incl. differentiation -* CRP -* D-dimer - -The doctor carries out the Blood count and the CRP determination himself by means of point of care diagnostics, the D-dimer diagnostics is prescribed as quantitative diagnostics in an external sending laboratory. To obtain the sample, a Blood sample is taken lying down (1 EDTA tube, 2 citrate tubes of 5 ml). The order is transmitted to the external laboratory and the sample is sent to the external dispatch laboratory by courier ordered by telephone. The results of the internal point of care diagnostics (Blood count and CRP) are entered in the patient's laboratory sheet in the doctor's office software (manually or via locally installed electronic interfaces). A prescription is therefore issued by the doctor to the patient for self-administration of an anti-thrombotic agent. -The results of the sending-in laboratory arrive electronically at the GP's on the same evening and are also entered in the patient's laboratory sheet. By using the present exchange format, this process can be fully automated. After a telephone enquiry by the doctor at the sending laboratory due to a borderline D-dimer result, the information is given that a deep vein thrombosis cannot be ruled out in this situation by means of D-dimer and the patient is therefore called back the next day for a sonography of the legs. - -Matching FHIR questionnaire that meets this specification: -[1-tvt.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-1-tvt.xml.html) -[1-tvt.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-1-tvt.json.html) - -As it is probably a primary leg vein thrombosis, Dr Eva Erlenmeier from the Pipette laboratory sends feedback to Dr Mustermann with the recommendation to carry out a thrombophilia screening, which includes the following analyses: -Quick, aPTT, fibrinogen, antithrombin (funct.), thrombin time I 2.5 NIH/ml, APC resistance, D-dimers, protein C, (aPTT method), protein S antigen. -The analyses can be carried out directly from the samples of the citrate tubes sent along. - -### Case study 2: Suspicion of whooping cough - -A mother visits the family doctor Peter Presto of the Olten group practice with her 6-year-old son Emil Kummer, born 5 May 2014, because the child has been coughing increasingly for a fortnight, with cramping cough attacks, and has a fever. The doctor's receptionist measures the fever, takes a fingertip Blood sample from the son, determines the CRP and prepares a Blood smear. The doctor suspects a viral infection, but wants to rule out whooping cough, although the child has been vaccinated against it. As he is under time pressure due to an emergency, he does not want to do the necessary throat swab himself, but asks the mother to accompany the child to the nearby laboratory to have the swab done in peace. -He prepares a laboratory order to carry out a pertussis PCR on the child's throat swab and gives the order to the mother. The mother herself is not sure whether she herself has been vaccinated against pertussis. Consequently, the family doctor Peter Presto gives her the pertussis vaccination right away and recommends that the same be done for the child's father and grandparents. In the meantime, the MPA has looked at the son's Blood smear under the microscope and finds a lot of reactive lymphocytes, which seem suspicious to her. She is unsure and asks the doctor, who gives the order to give the child's Blood smears to the mother and also to have them examined more closely in the laboratory. -The mother arrives at the laboratory with her son, where the doctor's order is first to establish the son's identity. Then a pharyngeal swab and a right cubital venepuncture are taken from the child in the laboratory's Blood collection room and passed on to the laboratory together with the Blood smears and the doctor's examination order. - -Matching FHIR questionnaire that meets this specification: -[2-pertussis.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-2-pertussis.xml.html) -[2-pertussis.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-2-pertussis.json.html) - -### Case study 3: Annual gynaecological check-up - -The doctor's assistent of the gynaecology department in the Olten group practice, Dr Peter Pap, prepares the next day's consultations. As the practice only has a minimal laboratory of its own, certain patients are sent to the nearby Pipette laboratory outpatient clinic before the appointment, including the young patient Ms Marina Rubella, born 8. 8. 1992. In her practice software, the MPA prescribes the standard analyses agreed with the laboratory for the gynaecological 3-year check-up for patient Rubella. This also includes the Blood sample for the serotonary for any follow-up prescriptions. -The laboratory transmits the results to the practice no later than 90 minutes after the Blood sample has been taken. Dr Pap prescribes the following orders during the consultation: - -* Gynaecological cervical cytology: Pap smear - if indicated, detection and typing of HPV (human papilloma virus) should also be performed. - Collection material according to the laboratory's instructions. - The cytological examination is carried out in the Pipette laboratory. The Pipette laboratory does not perform the typing itself. -* Partial urine status (Combur9 test): carried out by the MPA in the practice: the following parameters are examined: pH, leucocytes, erythrocytes, nitrite, protein, glucose, ketones, urobilinogen, bilirubin (semi-quantitative examinations, results are probably entered manually into the practice laboratory system). -* Urine bacteriology: collection material according to the laboratory's instructions. -General bact, incl. fungi to the laboratory pipette -Transmission of the order is triggered by the MPA (collection time) -* Supplementary order "Screening before pregnancy": All tests can be carried out from the materials (serum, EDTA Blood) taken in advance in the outpatient clinic (hepatitis-Bc antibodies, HIV 1+2 (Ak+p24), rubella IgG, lues/syphilis screening test) -* Mammography: Order for the Dr. Curie X-ray Institute. - -Matching FHIR questionnaire that meets this specification: -[3-gyn.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-3-gyn.xml.html) -[3-gyn.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-3-gyn.json.html) - -### Case study 4: Suspected sepsis - -The patient Sara Speckmann, born 12. 12. 1975, has been in the Cantonal Hospital for some time. Last night her general condition deteriorated massively. As there is a suspicion of sepsis, the senior physician in charge, Dr Hans Hauser, orders Blood to be taken from her in the morning for a Blood culture. 30 minutes later, another aerobic and an anaerobic Blood culture is taken, as well as a urine sample. -All five samples are further processed in the external laboratory Pipette. There, germs are detected in all materials and then identified by mass spectrometry. The pathogens "Klebsiella pneumoniae" and "Escherichia coli" were detected in the four Blood culture bottles, and the bacterium "Streptococcus mitis" was also detected in one aerobic bottle. The germ identified in the urine sample is normally not pathogenic. -An antibiogram is made of all three pathogens detected in the Blood. This shows that the two active substances "amoxicillin+clavulanic acid" and "ceftriaxone" are effective against all three germs. The microbiologist regularly informs Dr Hans Hauser about the various partial results. - -Matching FHIR questionnaire corresponding to this specification: -[4-sepsis.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-4-sepsis.xml.html) -[4-sepsis.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-4-sepsis.json.html) - -### Case study 5: Collective order "SUVA biological monitoring" - -Companies that work with substances hazardous to health and in which employees are exposed to special risks are subject to occupational health screening by SUVA. Biological monitoring is one of the control options. This assesses the exposure of workers to chemical agents by determining the agents or metabolites in biological material (e.g. urine). -The Occupational Medical Prevention (AMV) of SUVA sends the laboratory a monthly list with the following information per company (collective order): - -* Establishment (name, address, establishment number). -* Number of employees for biological monitoring -* Examinations to be carried out (e.g. arsenic, lead, mercury, mandelic acid). -The companies receive a list from the AMV including labels with the affected employees. Here we take the document of an employee Beat Borer, born 6. 6. 1986. The laboratory prints the order forms with the company number and sends the necessary number of urine cups and order forms to the companies. In the company, order forms and urine cups are labelled with the labels supplied by the AMV and given to the employees. The samples, including the order form, are sent from the company to the laboratory. - -[Biological monitoring SUVA] - -Matching FHIR questionnaire that corresponds to this specification: -[5-biol-monit.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-5-biol-monit.xml.html) -[5-biol-monit.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-5-biol-monit.json.html) - -### Case study 6: Suspected Melanoma, order for histopathology examination - -The 45-year-old female patient SimoneStuder came to Dr. med. Marc Mustermann in Arztpraxis for her regular skin check and this lesion was noted: Junctions nevi consisting of seborrheic area top end and atypical network constructed of many seperate dots, structures , etc , suggesting melanocytic involvement. Excision. -Attachement of dermatoscopic images -Specimen: 29 x 11 x 5 mm skin ellipse -Body Site: Back paralumbar left - -The skin sample, including the order form and the dermatoscopic image are sent to the laboratory. - -Matching FHIR questionnaire that corresponds to this specification: -[6-histopath.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-6-histopath.xml.html) -[6-histopath.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-6-histopath.json.html) diff --git a/input/pagecontent/casestudies-french.md b/input/pagecontent/casestudies-french.md deleted file mode 100644 index 5814dec2..00000000 --- a/input/pagecontent/casestudies-french.md +++ /dev/null @@ -1,86 +0,0 @@ - - -### Etude de cas 1 : Suspicion de thrombose veineuse profonde - -Un patient, Hans Guggindieluft, se présente au cabinet de groupe d'Olten du Dr méd. Marc Mustermann le 09.03.2016. Il s'identifie verbalement via ses données de base comme Hans Guggindieluft, 01.01.1981. Il rapporte une douleur peu claire dans la partie inférieure de la jambe gauche ainsi qu'une douleur respiratoire et une toux concomitantes. Le médecin procède à l'anamnèse et à l'examen physique et commande les paramètres de laboratoire suivants : - -* Numération sanguine, y compris le différentiel -* CRP -* D-dimère - -Le médecin effectue lui-même l'hémogramme et la détermination de la CRP à l'aide de diagnostics au point de service ; le diagnostic des D-dimères est prescrit en tant que diagnostic quantitatif dans un laboratoire expéditeur externe. Pour obtenir l'échantillon, une prise de sang est effectuée alors que le patient est allongé (1 tube EDTA, 2 tubes citrate de 5 ml). La commande est transmise au laboratoire externe et l'échantillon est envoyé au laboratoire d'expédition externe par courrier commandé par téléphone. Les résultats des diagnostics internes du point de service (numération sanguine et CRP) sont saisis dans la fiche de laboratoire du patient dans le logiciel du cabinet du médecin (manuellement ou via des interfaces électroniques installées localement). Une ordonnance du médecin est donc délivrée au patient pour l'auto-administration d'un agent antithrombotique. -Les résultats du laboratoire expéditeur arrivent électroniquement chez le médecin généraliste le soir même et sont également inscrits sur la fiche de laboratoire du patient. En utilisant le présent format d'échange, ce processus peut être entièrement automatisé. Après une demande téléphonique du médecin du laboratoire d'envoi en raison d'un résultat limite pour les D-dimères, l'information est donnée qu'une thrombose veineuse profonde ne peut être exclue dans cette situation au moyen des D-dimères et le patient est donc rappelé le lendemain pour qu'une échographie des jambes soit effectuée. - -Exemple FHIR correspondant qui répond à cette spécification : -[1-tvt.xml](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/tree/master/input/examples/bundle/1-tvt.xml) -[1-tvt.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-1-tvt.json.html) - -Comme il s'agit d'une thrombose veineuse primaire de la jambe, le Dr Eva Erlenmeier du laboratoire Pipette envoie un retour d'information au Dr Mustermann, lui recommandant d'effectuer un dépistage de la thrombophilie, qui comprend les analyses suivantes : -Quick, aPTT, fibrinogène, antithrombine (funct.), temps de thrombine I 2,5 NIH/ml, résistance APC, D-dimères, protéine C, (méthode aPTT), protéine S antigène. -Les analyses peuvent être effectuées directement à partir des échantillons des tubes de citrate envoyés. - -### Etude des cas 2: Suspicion de coqueluche - -Une mère se rend chez le médecin de famille Peter Presto du cabinet de groupe d'Olten avec son fils de 6 ans Emil Kummer, né le 5 mai 2014, car l'enfant tousse de plus en plus depuis quinze jours, avec des quintes de toux avec crampes, et a de la fièvre. La réceptionniste du médecin mesure la fièvre, prélève un échantillon de Sang au bout du doigt du fils, détermine la CRP et prépare un frottis sanguin. Le médecin soupçonne une infection virale, mais veut exclure la coqueluche, bien que l'enfant ait été vacciné contre cette maladie. Comme il est pressé par le temps en raison d'une urgence, il ne veut pas faire lui-même le prélèvement de gorge nécessaire, mais demande à la mère d'accompagner l'enfant au laboratoire voisin pour que le prélèvement soit effectué en toute tranquillité. -Il prépare un ordre de laboratoire pour effectuer une PCR coquelucheuse sur l'écouvillon de gorge de l'enfant et donne l'ordre à la mère. La mère elle-même n'est pas sûre d'avoir été vaccinée contre la coqueluche. Par conséquent, le médecin de famille Peter Presto lui administre immédiatement le vaccin contre la coqueluche et recommande de faire de même pour le père et les grands-parents de l'enfant. Entre-temps, l'AMP a examiné au microscope le frottis sanguin du fils et trouve beaucoup de lymphocytes réactifs, ce qui lui semble suspect. Elle a des doutes et interroge le médecin, qui donne l'ordre de remettre les frottis sanguins de l'enfant à la mère et de les faire examiner de plus près au laboratoire. -La mère arrive au laboratoire avec son fils, où l'ordre du médecin est d'abord d'établir l'identité du fils. Ensuite, un écouvillon pharyngé et une ponction veineuse cubitale droite sont prélevés sur l'enfant dans la salle de prélèvement sanguin du laboratoire et transmis au laboratoire avec les frottis sanguins et l'ordonnance d'examen du médecin. - -Questionnaire FHIR correspondant qui répond à cette spécification : - -[2-pertussis.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-2-pertussis.xml.html) -[2-pertussis.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-2-pertussis.json.html) - -### Etude des cas 3: Contrôle annuel gynécologique - -L'assistant du médecin du service de gynécologie du cabinet de groupe d'Olten, le Dr Peter Pap, prépare les consultations du lendemain. Comme le cabinet ne dispose que d'un laboratoire minimal, certains patients sont envoyés à la clinique externe du laboratoire Pipette voisin avant le rendez-vous, dont la jeune patiente Mme Marina Rubella, née le 8. 8. 1992. Dans son logiciel de cabinet, l'AMP prescrit les analyses standard convenues avec le laboratoire pour le contrôle gynécologique de 3 ans de la patiente Rubella. Ceci inclut également la prise de sang pour le sérologue pour d'éventuelles prescriptions de suivi. -Le laboratoire transmet les résultats au cabinet au plus tard 90 minutes après la prise de sang. Le Dr Pap prescrit les ordonnances suivantes lors de la consultation : - -* Cytologie cervicale gynécologique : Frottis cervical - si indiqué, la détection et le typage du HPV (virus du papillome humain) doivent également être effectués. - Matériel de prélèvement selon les instructions du laboratoire. - L'examen cytologique est réalisé dans le laboratoire Pipette. Le laboratoire Pipette ne réalise pas lui-même le typage. -* Bilan urinaire partiel (test Combur9) : effectué par l'AMP au cabinet : les paramètres suivants sont examinés : pH, leucocytes, érythrocytes, nitrites, protéines, glucose, cétones, urobilinogène, bilirubine (examens semi-quantitatifs, les résultats sont probablement saisis manuellement dans le système du laboratoire du cabinet). -* Bactériologie urinaire : matériel de prélèvement selon les instructions du laboratoire. -Bactérie générale, y compris les champignons à la pipette du laboratoire. -La transmission de l'ordonnance est déclenchée par l'AMP (heure de prélèvement). -* Ordre complémentaire "Dépistage avant grossesse" : Tous les tests peuvent être réalisés à partir du matériel (sérum, sang EDTA) prélevé au préalable en ambulatoire (anticorps anti-hépatite Bc, VIH 1+2 (Ak+p24), IgG rubéole, test de dépistage lues/syphilis). -* Mammographie : Commande pour l'Institut de radiologie Dr Curie. - -Questionnaire FHIR correspondant qui répond à cette spécification : -[3-gyn.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-3-gyn.xml.html) -[3-gyn.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-3-gyn.json.html) - -### Etude des cas 4: Septicémie suspectée - -La patiente Klebsiella Keller, né le 12. 12. 1975, se trouve depuis quelque temps à l'Hôpital cantonal. La nuit dernière, son état général s'est massivement détérioré. En raison d'une suspicion de septicémie, le médecin-chef responsable, le Dr Hans Hauser, ordonne un prélèvement de sang dans la matinée pour une hémoculture. 30 minutes plus tard, une autre hémoculture aérobie et une anaérobie sont prélevées, ainsi qu'un échantillon d'urine. -Les cinq échantillons sont ensuite traités dans la pipette du laboratoire externe. Là, les germes sont détectés dans tous les matériaux, puis identifiés par spectrométrie de masse. Les agents pathogènes "Klebsiella pneumoniae" et "Escherichia coli" ont été détectés dans les quatre flacons d'hémoculture, et la bactérie "Streptococcus mitis" a également été détectée dans un flacon d'aérobiose. Le germe identifié dans l'échantillon d'urine n'est normalement pas pathogène. -Un antibiogramme est réalisé pour les trois pathogènes détectés dans le sang. Celui-ci montre que les deux substances actives "amoxicilline+acide clavulanique" et "ceftriaxone" sont efficaces contre les trois germes. Le microbiologiste informe régulièrement le Dr Hans Hauser des différents résultats partiels. - -Questionnaire FHIR correspondant à cette spécification: -[4-sepsis.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-4-sepsis.xml.html) -[4-sepsis.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-4-sepsis.json.html) - -### Etude des cas 5: Commande collective "Surveillance biologique de la SUVA" - -Les entreprises qui travaillent avec des substances dangereuses pour la santé et dans lesquelles les employés sont exposés à des risques particuliers sont soumises à un dépistage de la santé au travail par la SUVA. La surveillance biologique est l'une des possibilités de contrôle. Elle permet d'évaluer l'exposition des travailleurs à des agents chimiques en déterminant les agents ou les métabolites dans le matériel biologique (par exemple l'urine). -L'AMV (Prévention Médicale du Travail) de la SUVA envoie au laboratoire une liste mensuelle avec les informations suivantes par entreprise (ordre collectif) : - -* Établissement (nom, adresse, numéro d'établissement). -* Nombre de salariés pour le suivi biologique -* Examens à effectuer (p.ex. arsenic, plomb, mercure, acide mandélique). -Les entreprises reçoivent de l'AMV une liste comprenant des étiquettes avec les employés concernés. Nous prenons ici le document d'un employé Beat Borer, né le 6. 6. 1986. Le laboratoire imprime les bons de commande avec le numéro de l'entreprise et envoie le nombre nécessaire de gobelets à urine et de bons de commande aux entreprises. Dans l'entreprise, les formulaires de commande et les gobelets à urine sont étiquetés avec les étiquettes fournies par l'AMV et remis aux employés. Les échantillons, y compris le bon de commande, sont envoyés de l'entreprise au laboratoire. - -[Surveillance biologique SUVA] - -Questionnaire FHIR correspondant à cette spécification: -[5-biol-monit.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-5-biol-monit.xml.html) -[5-biol-monit.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-5-biol-monit.json.html) - -### Étude de cas n° 6 : suspicion de mélanome, demande d'examen histopathologique - -Une patiente de 45 ans s'est présentée pour un examen régulier de la peau et cette lésion a été observée : Naevus de jonction composé d'une zone séborrhéique à l'extrémité supérieure et d'un réseau atypique constitué de nombreux points, structures, etc. distincts, suggérant une implication mélanocytaire. Excision. Joindre les images dermatoscopiques Spécimen : Ellipse cutanée de 29 x 11 x 5 mm Site corporel : Dos paralombaire gauche - -L'échantillon de peau, le formulaire de commande et l'image dermatoscopique sont envoyés au laboratoire. - -Questionnaire FHIR correspondant à cette spécification: -[6-histopath.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-6-histopath.xml.html) -[6-histopath.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-6-histopath.json.html) diff --git a/input/pagecontent/casestudies-german.md b/input/pagecontent/casestudies-german.md deleted file mode 100644 index 13538a99..00000000 --- a/input/pagecontent/casestudies-german.md +++ /dev/null @@ -1,85 +0,0 @@ -### Fallbeispiel 1: Verdacht auf tiefe Venenthrombose - -Ein Patient, Hans Guggindieluft, erscheint am 09.03.2016 in der Gruppenpraxis Olten bei Dr. med. Marc Mustermann. Er identifiziert sich mündlich über seine Stammdaten als Hans Guggindieluft, 01.01.1981. Er berichtet über unklare Beinschmerzen im linken Unterschenkel sowie gleichzeitig aufgetretene atemabhängige Schmerzen und Husten. Der Arzt führt die Anamnese und körperliche Untersuchung durch und verordnet folgende Laborparameter: - -* Blutbild inkl. Differenzierung -* CRP -* D-Dimer - -Der Arzt führt selber das Blutbild und die CRP-Bestimmung mittels Point of care Diagnostik durch, die D-Dimer-Diagnostik wird als Quantitative Diagnostik in einem externen Einsendelabor verordnet. Zur Gewinnung der Probe wird eine Blutentnahme im Liegen durchgeführt (1 EDTA-Röhrchen, 2 Citrat-Röhrchen zu 5 ml). Der Auftrag wird an das externe Labor übermittelt und die Probe wird mittels telefonisch geordertem Kurier in das externe Versandlabor geschickt. Die Resultate der internen Point of Care-Diagnostik (Blutbild und CRP) werden im Laborblatt des Patienten in der Arztpraxis-Software eingetragen (händisch oder über lokal installierte elektronische Schnittstellen). Es erfolgt daher eine Verordnung des Arztes an den Patienten zur Selbstverabreichung eines thrombosehemmenden Mittels. -Die Resultate des Einsendelabors treffen am gleichen Abend elektronisch beim Hausarzt ein und werden ebenfalls im Laborblatt des Patienten eingetragen. Durch den Einsatz des vorliegenden Austauschformats kann dieser Prozess vollautomatisch erfolgen. Nach telefonischer Rückfrage des Arztes beim Einsendelabor auf Grund eines grenzwertigen D-Dimer-Befundes erfolgt die Auskunft, dass mittels D-Dimer in dieser Situation eine tiefe Venenthrombose nicht ausgeschlossen werden kann und es erfolgt daher eine telefonische Wiedereinbestellung des Patienten am nächsten Tag zur Durchführung einer Sonographie der Beine. - -Dazu passendes FHIR Formular, welches dieser Spezifikation entspricht: -[1-tvt.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-1-tvt.xml.html) -[1-tvt.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-1-tvt.json.html) - -Da es sich um eine primäre Beinvenenthrombose handelt, sendet Frau Dr. Eva Erlenmeier vom Labor Pipette ein Feedback an Dr. Mustermann, mit der Empfehlung, ein Thrombophilie-Screening durchzuführen, welches folgende Analysen enthält: -Quick, aPTT, Fibrinogen, Antithrombin (funkt.), Thrombinzeit I 2.5 NIH/ml, APC Resistenz, D-Dimere, Protein C, (aPTT Methode), Protein S-Antigen -Die Analysen können direkt von den mitgeschickten Proben der Citrat-Röhrchen erfolgen. - -### Fallbeispiel 2: Verdacht auf Keuchhusten - -TODO: Zu diesem Fallbeispiel befinden sich im Whitepaper[1], Anhang 8.7 konkrete Beispieldokumente. Die « Abbildung 2 » im Whitepaper[1] zeigt das zu diesem Fallbeispiel gehörende Use Case Diagramm. - -Eine Mutter sucht mit ihrem 6-jährigen Sohn Emil Kummer, geb. 5. Mai 2014, den Hausarzt Peter Presto der Gruppenpraxis Olten auf, weil das Kind seit zwei Wochen zunehmend hustet, mit krampfartigen Hustenanfällen, und Fieber hat. Die MPA der Arztpraxis misst das Fieber, macht bereits eine Fingerkuppen-Blutentnahme beim Sohn, bestimmt das CRP und fertigt einen Blutausstrich an. Der Arzt vermutet einen viralen Infekt, möchte aber Keuchhusten ausschliessen, obwohl das Kind dagegen geimpft ist. Da er wegen eines Notfalles unter Zeitdruck ist, möchte er den dazu nötigen Rachenabstrich nicht selbst durchführen, sondern bittet die Mutter, das Kind ins nahegelegene Labor zu begleiten, um den Abstrich in Ruhe anfertigen zu lassen. -Er erstellt einen Laborauftrag zur Durchführung einer Pertussis-PCR im Rachenabstrich des Kindes und gibt den Auftrag der Mutter mit. Die Mutter selbst ist nicht sicher, ob sie selbst gegen Keuchhusten geimpft ist. Demzufolge nimmt der Hausarzt Peter Presto die Pertussis-Impfung bei ihr gleich vor und empfiehlt, dasselbe beim Kindsvater und bei den Grosseltern durchzuführen. Die MPA hat inzwischen den Blutausstrich des Sohnes im Mikroskop angeschaut und findet ausgesprochen viele reaktive Lymphozyten, die ihr verdächtig erscheinen. Sie ist unsicher und fragt den Arzt, welcher den Auftrag gibt, die Blutausstriche des Kindes der Mutter mitzugeben und ebenfalls im Labor genauer untersuchen zu lassen. -Die Mutter findet sich mit ihrem Sohn im Labor ein, wo auf Grund des Untersuchungsauftrages des Arztes vorerst die Identität des Sohnes festgestellt wird. Anschliessend wird im Blutentnahmeraum des Labors beim Kind ein Rachenabstrich sowie eine Venenpunktion cubital rechts durchgeführt und zusammen mit den mitgebrachten Blutausstrichen und dem Untersuchungsauftrag des Arztes ins Labor weitergegeben. - -Dazu passendes FHIR Formular, welches dieser Spezifikation entspricht: -[2-pertussis.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-2-pertussis.xml.html) -[2-pertussis.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-2-pertussis.json.html) - -### Fallbeispiel 3: Gynäkologische Jahreskontrolle - -Die MPA der Gynäkologie in der Gruppenpraxis Olten, Dr. Peter Pap bereitet die Konsultationen des nächsten Tages vor. Da die Praxis nur ein minimales eigenes Labor betreibt, werden gewisse Patientinnen vor dem Besuchstermin ins nahe gelegene Ambulatorium des Labors Pipette geschickt, so auch die junge Patientin Frau Marina Rubella, geb. 8. 8. 1992. Die MPA verordnet in ihrer Praxis-Software für die Patientin Rubella die mit dem Labor vereinbarten Standard-Analysen für die gynäkologische 3-Jahreskontrolle. Dazu gehört auch die Blutentnahme für die Serothek für allfällige Nachverordnungen. -Das Labor übermittelt die Resultate spätestens 90 Minuten nach der Blutentnahme in die Praxis. Dr. Pap verordnet während der Konsultation folgende Aufträge: - -* Gynäkologische Zervix Zytologie: Pap-Abstrich - falls indiziert soll auch der Nachweis und die Typisierung von HPV (Humane Papillomaviren) durchgeführt werden. - Entnahmematerial gemäss Angaben des Labors. - Die zytologische Untersuchung wird im Labor Pipette durchgeführt. Die allfällige Typisierung führt das Labor Pipette nicht selber durch. -* Urin-Teilstatus (Combur9 Test): Wird durch die MPA in der Praxis durchgeführt: folgende Parameter werden untersucht: ph, Leukozyten, Erythrozyten, Nitrit, Protein, Glucose, Ketone, Urobilinogen, Bilirubin (halbquantitative Untersuchungen, Resultate werden wahrscheinlich von Hand ins Praxis-Laborsystem eingetragen) -* Urin-Bakteriologie: Entnahmematerial gemäss Angaben des Labors -Allgemeine Bakt, inkl. Sprosspilze ans Labor Pipette -Die Übermittlung des Auftrags wird durch die MPA ausgelöst (Entnahmezeitpunkt) -* Nachverordnung "Screening vor Schwangerschaft": Alle Untersuchungen können aus den vorgängig im Ambulatorium entnommenen Materialien (Serum, EDTA-Blut) durchgeführt werden (Hepatitis-Bc Antikörper, HIV 1+2 (Ak+p24), Röteln IgG, Lues-/Syphilis-Suchtest) -* Mammographie: Auftrag für das Röntgeninstitut Dr. Curie, gemäss CH RAD-Order - -Dazu passendes FHIR Formular, welches dieser Spezifikation entspricht: -[3-gyn.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-3-gyn.xml.html) -[3-gyn.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-3-gyn.json.html) - -### Fallbeispiel 4: Verdacht auf eine Sepsis - -Die Patientin Klebsiella Keller, geb. 12. 12. 1975, ist schon seit längerer Zeit im Kantonsspital. In der vergangenen Nacht hat sich ihr Allgemeinzustand massiv verschlechtert. Da ein Verdacht auf eine Sepsis besteht, ordnet der zuständige Oberarzt, Dr. Hans Hauser, an, dass ihr am Morgen Blut für eine Blutkultur entnommen wird. 30 Minuten später wird nochmals eine aerobe und eine anaerobe Blutkultur angelegt, sowie eine Urinprobe gewonnen. -Alle fünf Proben werden im externen Labor Pipette weiter bearbeitet. Dort werden in allen Materialien Keime nachgewiesen und dann mittels Massenspektrometrie identifiziert. In den vier Blutkulturflaschen konnten die Erreger „Klebsiella pneumoniae“ und „Escherichia coli“ nachgewiesen werden, in einer aeroben Flasche noch zusätzlich das Bakterium „Streptococcus mitis“. Der in der Urinprobe identifizierte Keim ist normalerweise nicht pathogen. -Von allen drei im Blut nachgewiesenen Erreger wird ein Antibiogramm erstellt. Dabei zeigt sich, dass die beiden Wirkstoffe “Amoxicillin+Clavulansäure“ und „Ceftriaxon“ bei allen drei Keimen wirksam sind. Der Mikrobiologe informiert Dr. Hans Hauser regelmässig über die verschiedenen Teilresultate. - -Dazu passendes FHIR Formular, welches dieser Spezifikation entspricht: -[4-sepsis.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-4-sepsis.xml.html) -[4-sepsis.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-4-sepsis.json.html) - -### Fallbeispiel 5: Sammelauftrag „Biologisches Monitoring SUVA“ - -Betriebe, welche mit gesundheitsgefährdenden Stoffen arbeiten und in denen Arbeitnehmende speziellen Risiken ausgesetzt sind, werden von der SUVA der arbeitsmedizinischen Vorsorge unterstellt. Eine Kontrollmöglichkeit ist die Biologische Überwachung. Diese beurteilt die Exposition von Arbeitnehmenden gegenüber chemischen Arbeitsstoffen durch die Bestimmung der Arbeitsstoffe oder von Metaboliten (Umwandlungsprodukten) im biologischen Material (z.B. Urin). -Die Arbeitsmedizinische Vorsorge (AMV) der SUVA sendet dem Labor monatlich eine Liste mit folgenden Informationen pro Betrieb (Sammelauftrag): - -* Betrieb (Name, Adresse, Betriebs-Nummer) -* Anzahl Arbeitnehmende für das Biologische Monitoring -* durchzuführende Untersuchungen (z.B. Arsen, Blei, Quecksilber, Mandelsäure) -Die Betriebe erhalten von der AMV eine Liste inkl. Etiketten mit den betroffenen Arbeitnehmenden. Hier nehmen wir als Beispiel für einen Arbeitnehmer Beat Borer, geb. 6. 6. 1986. Das Labor bedruckt die Auftragsformulare mit der Betriebsnummer und sendet den Betrieben die notwendige Anzahl Urinbecher und Auftragsformulare zu. Im Betrieb werden Auftragsformulare und Urinbecher mit den von der AMV gelieferten Etiketten versehen und an die Arbeitnehmenden abgegeben. Die Proben inkl. Auftragsformular werden vom Betrieb ans Labor gesendet. - -[Biologisches Monitoring SUVA](https://www.suva.ch/de-CH/material/Factsheets/biologisches-monitoring-und-biologische-arbeitsstofftoleranzwerte) - -Dazu passendes FHIR Formular, welches dieser Spezifikation entspricht: -[5-biol-monit.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-5-biol-monit.xml.html) -[5-biol-monit.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-5-biol-monit.json.html) - -### Fallbeispiel 6: Verdacht auf Melanom, Anordnung einer histopathologischen Untersuchung - -Eine 45-jährige Patientin kam zu ihrer regelmäßigen Hautuntersuchung und es wurde diese Läsion festgestellt: Verbindungsnävi, bestehend aus einem seborrhoischen Bereich am oberen Ende und einem atypischen Netzwerk aus vielen einzelnen Punkten, Strukturen usw., was auf eine melanozytäre Beteiligung hindeutet. Exzision. Beifügung dermatoskopischer Bilder Präparat: 29 x 11 x 5 mm Hautellipse Körperstelle: Rücken paralumbar links - -Die Hautprobe wird zusammen mit dem Auftragsformular und dem dermatoskopischen Bild an das Labor gesandt. - -Passende FHIR-Formular, das dieser Spezifikation entspricht: -[6-histopath.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-6-histopath.xml.html) -[6-histopath.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-6-histopath.json.html) From 0744924ffaa99a7892cca0a34f8abfbf0e066c30 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: lpg-tech Date: Thu, 7 Dec 2023 02:18:11 +0100 Subject: [PATCH 5/8] fix typos --- input/fsh/profiles/ChLabOrderComposition.fsh | 2 +- input/fsh/profiles/ChLabOrderCompositionByForm.fsh | 2 +- 2 files changed, 2 insertions(+), 2 deletions(-) diff --git a/input/fsh/profiles/ChLabOrderComposition.fsh b/input/fsh/profiles/ChLabOrderComposition.fsh index be46cf56..ddcc4557 100644 --- a/input/fsh/profiles/ChLabOrderComposition.fsh +++ b/input/fsh/profiles/ChLabOrderComposition.fsh @@ -2,7 +2,7 @@ Profile: ChLabOrderComposition Parent: CHCoreComposition // ChOrfComposition replaced by Composition Id: ch-lab-order-composition Title: "CH LAB-Order Composition by Service Request" -Description: "Definition for Composition resource in the context of CH CH LAB-Order by Service Request" +Description: "Definition for Composition resource in the context of CH LAB-Order by Service Request" * . ^short = "CH LAB-Order Composition" * ^version = "0.9.0" * ^status = #draft diff --git a/input/fsh/profiles/ChLabOrderCompositionByForm.fsh b/input/fsh/profiles/ChLabOrderCompositionByForm.fsh index 64ce4d44..98b7efda 100644 --- a/input/fsh/profiles/ChLabOrderCompositionByForm.fsh +++ b/input/fsh/profiles/ChLabOrderCompositionByForm.fsh @@ -2,7 +2,7 @@ Profile: ChLabOrderCompositionByForm Parent: ChOrfComposition Id: ch-lab-order-composition-form Title: "CH LAB-Order Composition by Form" -Description: "Definition for Composition resource in the context of CH CH LAB-Order by Form" +Description: "Definition for Composition resource in the context of CH LAB-Order by Form" * . ^short = "CH LAB-Order Composition" * ^version = "0.9.0" * ^status = #draft From edb7ae3a533323481483edef7e1b9ec03abc198a Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: lpg-tech Date: Thu, 7 Dec 2023 10:07:55 +0100 Subject: [PATCH 6/8] fix links in Use Cases files --- input/pagecontent/changelog.md | 58 ++++++++++++++++++++------- input/pagecontent/usecases-english.md | 2 +- input/pagecontent/usecases-french.md | 1 - input/pagecontent/usecases-german.md | 3 +- 4 files changed, 45 insertions(+), 19 deletions(-) diff --git a/input/pagecontent/changelog.md b/input/pagecontent/changelog.md index bbdd1324..5afb85cd 100644 --- a/input/pagecontent/changelog.md +++ b/input/pagecontent/changelog.md @@ -2,19 +2,45 @@ All significant changes to this FHIR implementation guide will be documented on this page. -### STU 2 Ballot - #### Open Issues for STU 3 -* [Issue #260](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/260) Using Laboratory Catalogue: Most of the issues below are based on this issue. -* [Issue #253](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/253) shift license to CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) +* [Issue#296](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/296) Add task resource to enable workflow communication + +* [Issue #260](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/260) Using Laboratory Catalogue + +* [Issue #72](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/72) Relation between Tests and Specimens my be needed. The relation should be established by a test-specific PlanDefinition as extension specimenRequested, which points to the test-specific SpecimenDefinition. The test-specific PlanDefinition and SpecimenDefinitin should be provided by a LabCatalog/Compendium. So the Lab Organization can independently define their tests with all the needed preanalytic conditions. + * [Issue #128](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/128) Mapping reasonCode und reasonReference from Q to SR + * [Issue #127](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/127) Mapping Questionnaire code to Service Request code -* [Issue #88](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/88) The pre-analytical conditions and any limitations are specified in the laboratory catalogue. These include, for example, the fasting of the patient, the type of sample container, the storage period and temperature of the sample, the reasons for rejection, etc. In addition, the costs of Vitamim D determination are only covered by health insurance in certain situations, e.g. rickets, osteoporosis, etc. -* [Issue #87](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/87) Relations between Specimens and Tests. Refer to [Issue #72](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/72) -* [Issue #80](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/80) User should be able to select analyses or analyse panels from a Laboratory Catalog. The applies to Specimens -* [Issue #79](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/79) Pick desired Analyses and Specimens from am Catalog -* [Issue #72](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/72) Relation between Tests and Specimens my be needed. The relation should be established by a test-specific PlanDefinition as extension specimenRequested, which points to the test-specific SpecimenDefinition. The test-specific PlanDefinition and SpecimenDefinitin should be provided by a LabCatalog/Compendium. So the Lab Organization can independently define their tests with all the needed preanalytic conditions. + +### STU 2 Ballot + +* [Isssue # 284](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/284) Home - IG Fragments (Safety Considerations) (Patrick Jolo eHealth Suisse) - changed + +* [Isssue # 282](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/282) Examples needed that indicate request of analyses and linked information (Corina von Känel) - Example added + +* [Isssue # 281](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/281) Use Cases in German: use case 10 a specialised case of use case 2? (Emmanuel Eschmann, CISTEC) - All Use Cases and translations refactored because of making the order using Questionnaire and QuestionnaireResponse as option + +* [Isssue # 280](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/280) FHIR IGs must not have a TODO to be eligible for FMM Level 3 (Emmanuel Eschmann, CISTEC) - open TODOs resolved + +* [Isssue # 279](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/279) Use Cases in German: Profile for use case 2? (Emmanuel Eschmann, CISTEC) - All Use Cases and translations refactored because of making the order using Questionnaire and QuestionnaireResponse as option + +* [Isssue # 278](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/278) Mismatch between use case 2 in English and in German (Emmanuel Eschmann, CISTEC) - All Use Cases and translations refactored because of making the order using Questionnaire and QuestionnaireResponse as option + +* [Isssue # 277](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/277) Management Summary Change - rewording (Corina von Känel, CISTEC AG) - Management summary text has been modified. + +* [Isssue # 276](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/276) Ordering of Containers, Blood Pressure instruments should not be covered by lab order (Corina von Känel, CISTEC AG) - Ordering of non laboratory sample measurments is no more part of the IG + +* [Isssue # 275](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/275) Home: Typos (Michaela Ziegler, ahdis ag) - Typos fixed + +* [Isssue # 274](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/274) CH LAB-ORDER Document Profile: Spelling (Michaela Ziegler, ahdis ag) - Spelling is unfied + +* [Isssue # 272](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/272) Case Studies in German (Gabriel Hess, BFH I4MI) #272 - Links fixed + +* [Issue #253](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/253) shift license to CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) - Switched to CC + +#### Open Issues for STU #### Follow up of changes in CH-orf @@ -24,6 +50,14 @@ All significant changes to this FHIR implementation guide will be documented on * [Issue #132](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/132) Try to build a Questionnaire with a general part and 6 specific parts: [Questionnaire Specification](http://build.fhir.org/ig/hl7ch/ch-lab-order/Questionnaire-LabOrder-form.html) +* [Issue #88](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/88) The pre-analytical conditions and any limitations are specified in the laboratory catalogue. These include, for example, the fasting of the patient, the type of sample container, the storage period and temperature of the sample, the reasons for rejection, etc. In addition, the costs of Vitamim D determination are only covered by health insurance in certain situations, e.g. rickets, osteoporosis, etc. + +* [Issue #87](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/87) Relations between Specimens and Tests. Refer to [Issue #72](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/72) + +* [Issue #80](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/80) User should be able to select analyses or analyse panels from a Laboratory Catalog. The applies to Specimens + +* [Issue #79](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/79) Pick desired Analyses and Specimens from am Catalog + * [Issue #78](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/78) Test to be performed is missing in ServiceRequest.code * [Issue #77](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/issues/77) Pathology Order: Case Study and Instance is added: Case study 6: Suspected Melanoma, order for histopathology examination @@ -50,14 +84,8 @@ correct assignment of the patient identification number. In principle, several i * Replace: Use Case 2: Verordnung zusätzlicher Untersuchungen der gleichen Probe with Use Case 2: Laborverordnung ohne Verwendung von Questionnaire und QuestionnaireResponse -<<<<<<< HEAD -* Remove: Use Case 6: Vorschlag von zusätzlichen oder alternativen Untersuchungen durch den Laborarzt (Auftragsempfänger, receiver) - -* Remove: Use Case 4: Anfordern von vorhandenen Laborresultaten und Bildern. -======= * Add example: Use Case 6: Vorschlag von zusätzlichen oder alternativen Untersuchungen durch den Laborarzt (Auftragsempfänger, receiver) * Modify: Use Case 4: Anfordern von vorhandenen Laborresultaten und Bildern. * Remove: Use Case 9: Anfordern von Monitoring-Untersuchungen (nicht empfohlen) ->>>>>>> IG-ohne-Q diff --git a/input/pagecontent/usecases-english.md b/input/pagecontent/usecases-english.md index 6355aef5..770bf865 100644 --- a/input/pagecontent/usecases-english.md +++ b/input/pagecontent/usecases-english.md @@ -47,7 +47,7 @@ Outside of this use case: the results are then reported back to the client. Example document: -tvt by Form +tvt by Form ### Use Case 3: Requesting additional examinations of the same sample diff --git a/input/pagecontent/usecases-french.md b/input/pagecontent/usecases-french.md index 3664af49..004b917d 100644 --- a/input/pagecontent/usecases-french.md +++ b/input/pagecontent/usecases-french.md @@ -1,5 +1,4 @@ - -