From 28fa34eb40b8e2a9cabaf608fe4717c5be55663c Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: lpg-tech Date: Thu, 7 Dec 2023 01:42:16 +0100 Subject: [PATCH] rm all casestudy files --- input/pagecontent/case-study-document.md | 3 - input/pagecontent/casestudies-english.md | 88 ------------------------ input/pagecontent/casestudies-french.md | 86 ----------------------- input/pagecontent/casestudies-german.md | 85 ----------------------- 4 files changed, 262 deletions(-) delete mode 100644 input/pagecontent/case-study-document.md delete mode 100644 input/pagecontent/casestudies-english.md delete mode 100644 input/pagecontent/casestudies-french.md delete mode 100644 input/pagecontent/casestudies-german.md diff --git a/input/pagecontent/case-study-document.md b/input/pagecontent/case-study-document.md deleted file mode 100644 index 116f5e3f..00000000 --- a/input/pagecontent/case-study-document.md +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ - - -### FHIR document (Bundle) diff --git a/input/pagecontent/casestudies-english.md b/input/pagecontent/casestudies-english.md deleted file mode 100644 index 0b24acb9..00000000 --- a/input/pagecontent/casestudies-english.md +++ /dev/null @@ -1,88 +0,0 @@ - - -### Case study 1: Suspicion of deep vein thrombosis - -A patient, Tomas Timmermann, presents to Dr. med. Marc Mustermann at the Olten group practice on 09.03.2016. He verbally identifies himself via his master data as Tomas Timmermann, 01.01.1984. He reports unclear leg pain in the left lower leg as well as simultaneously occurring respiratory pain and cough. The doctor carries out the anamnesis and physical examination and prescribes the following laboratory parameters: - -* Blood cell count incl. differentiation -* CRP -* D-dimer - -The doctor carries out the Blood count and the CRP determination himself by means of point of care diagnostics, the D-dimer diagnostics is prescribed as quantitative diagnostics in an external sending laboratory. To obtain the sample, a Blood sample is taken lying down (1 EDTA tube, 2 citrate tubes of 5 ml). The order is transmitted to the external laboratory and the sample is sent to the external dispatch laboratory by courier ordered by telephone. The results of the internal point of care diagnostics (Blood count and CRP) are entered in the patient's laboratory sheet in the doctor's office software (manually or via locally installed electronic interfaces). A prescription is therefore issued by the doctor to the patient for self-administration of an anti-thrombotic agent. -The results of the sending-in laboratory arrive electronically at the GP's on the same evening and are also entered in the patient's laboratory sheet. By using the present exchange format, this process can be fully automated. After a telephone enquiry by the doctor at the sending laboratory due to a borderline D-dimer result, the information is given that a deep vein thrombosis cannot be ruled out in this situation by means of D-dimer and the patient is therefore called back the next day for a sonography of the legs. - -Matching FHIR questionnaire that meets this specification: -[1-tvt.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-1-tvt.xml.html) -[1-tvt.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-1-tvt.json.html) - -As it is probably a primary leg vein thrombosis, Dr Eva Erlenmeier from the Pipette laboratory sends feedback to Dr Mustermann with the recommendation to carry out a thrombophilia screening, which includes the following analyses: -Quick, aPTT, fibrinogen, antithrombin (funct.), thrombin time I 2.5 NIH/ml, APC resistance, D-dimers, protein C, (aPTT method), protein S antigen. -The analyses can be carried out directly from the samples of the citrate tubes sent along. - -### Case study 2: Suspicion of whooping cough - -A mother visits the family doctor Peter Presto of the Olten group practice with her 6-year-old son Emil Kummer, born 5 May 2014, because the child has been coughing increasingly for a fortnight, with cramping cough attacks, and has a fever. The doctor's receptionist measures the fever, takes a fingertip Blood sample from the son, determines the CRP and prepares a Blood smear. The doctor suspects a viral infection, but wants to rule out whooping cough, although the child has been vaccinated against it. As he is under time pressure due to an emergency, he does not want to do the necessary throat swab himself, but asks the mother to accompany the child to the nearby laboratory to have the swab done in peace. -He prepares a laboratory order to carry out a pertussis PCR on the child's throat swab and gives the order to the mother. The mother herself is not sure whether she herself has been vaccinated against pertussis. Consequently, the family doctor Peter Presto gives her the pertussis vaccination right away and recommends that the same be done for the child's father and grandparents. In the meantime, the MPA has looked at the son's Blood smear under the microscope and finds a lot of reactive lymphocytes, which seem suspicious to her. She is unsure and asks the doctor, who gives the order to give the child's Blood smears to the mother and also to have them examined more closely in the laboratory. -The mother arrives at the laboratory with her son, where the doctor's order is first to establish the son's identity. Then a pharyngeal swab and a right cubital venepuncture are taken from the child in the laboratory's Blood collection room and passed on to the laboratory together with the Blood smears and the doctor's examination order. - -Matching FHIR questionnaire that meets this specification: -[2-pertussis.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-2-pertussis.xml.html) -[2-pertussis.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-2-pertussis.json.html) - -### Case study 3: Annual gynaecological check-up - -The doctor's assistent of the gynaecology department in the Olten group practice, Dr Peter Pap, prepares the next day's consultations. As the practice only has a minimal laboratory of its own, certain patients are sent to the nearby Pipette laboratory outpatient clinic before the appointment, including the young patient Ms Marina Rubella, born 8. 8. 1992. In her practice software, the MPA prescribes the standard analyses agreed with the laboratory for the gynaecological 3-year check-up for patient Rubella. This also includes the Blood sample for the serotonary for any follow-up prescriptions. -The laboratory transmits the results to the practice no later than 90 minutes after the Blood sample has been taken. Dr Pap prescribes the following orders during the consultation: - -* Gynaecological cervical cytology: Pap smear - if indicated, detection and typing of HPV (human papilloma virus) should also be performed. - Collection material according to the laboratory's instructions. - The cytological examination is carried out in the Pipette laboratory. The Pipette laboratory does not perform the typing itself. -* Partial urine status (Combur9 test): carried out by the MPA in the practice: the following parameters are examined: pH, leucocytes, erythrocytes, nitrite, protein, glucose, ketones, urobilinogen, bilirubin (semi-quantitative examinations, results are probably entered manually into the practice laboratory system). -* Urine bacteriology: collection material according to the laboratory's instructions. -General bact, incl. fungi to the laboratory pipette -Transmission of the order is triggered by the MPA (collection time) -* Supplementary order "Screening before pregnancy": All tests can be carried out from the materials (serum, EDTA Blood) taken in advance in the outpatient clinic (hepatitis-Bc antibodies, HIV 1+2 (Ak+p24), rubella IgG, lues/syphilis screening test) -* Mammography: Order for the Dr. Curie X-ray Institute. - -Matching FHIR questionnaire that meets this specification: -[3-gyn.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-3-gyn.xml.html) -[3-gyn.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-3-gyn.json.html) - -### Case study 4: Suspected sepsis - -The patient Sara Speckmann, born 12. 12. 1975, has been in the Cantonal Hospital for some time. Last night her general condition deteriorated massively. As there is a suspicion of sepsis, the senior physician in charge, Dr Hans Hauser, orders Blood to be taken from her in the morning for a Blood culture. 30 minutes later, another aerobic and an anaerobic Blood culture is taken, as well as a urine sample. -All five samples are further processed in the external laboratory Pipette. There, germs are detected in all materials and then identified by mass spectrometry. The pathogens "Klebsiella pneumoniae" and "Escherichia coli" were detected in the four Blood culture bottles, and the bacterium "Streptococcus mitis" was also detected in one aerobic bottle. The germ identified in the urine sample is normally not pathogenic. -An antibiogram is made of all three pathogens detected in the Blood. This shows that the two active substances "amoxicillin+clavulanic acid" and "ceftriaxone" are effective against all three germs. The microbiologist regularly informs Dr Hans Hauser about the various partial results. - -Matching FHIR questionnaire corresponding to this specification: -[4-sepsis.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-4-sepsis.xml.html) -[4-sepsis.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-4-sepsis.json.html) - -### Case study 5: Collective order "SUVA biological monitoring" - -Companies that work with substances hazardous to health and in which employees are exposed to special risks are subject to occupational health screening by SUVA. Biological monitoring is one of the control options. This assesses the exposure of workers to chemical agents by determining the agents or metabolites in biological material (e.g. urine). -The Occupational Medical Prevention (AMV) of SUVA sends the laboratory a monthly list with the following information per company (collective order): - -* Establishment (name, address, establishment number). -* Number of employees for biological monitoring -* Examinations to be carried out (e.g. arsenic, lead, mercury, mandelic acid). -The companies receive a list from the AMV including labels with the affected employees. Here we take the document of an employee Beat Borer, born 6. 6. 1986. The laboratory prints the order forms with the company number and sends the necessary number of urine cups and order forms to the companies. In the company, order forms and urine cups are labelled with the labels supplied by the AMV and given to the employees. The samples, including the order form, are sent from the company to the laboratory. - -[Biological monitoring SUVA] - -Matching FHIR questionnaire that corresponds to this specification: -[5-biol-monit.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-5-biol-monit.xml.html) -[5-biol-monit.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-5-biol-monit.json.html) - -### Case study 6: Suspected Melanoma, order for histopathology examination - -The 45-year-old female patient SimoneStuder came to Dr. med. Marc Mustermann in Arztpraxis for her regular skin check and this lesion was noted: Junctions nevi consisting of seborrheic area top end and atypical network constructed of many seperate dots, structures , etc , suggesting melanocytic involvement. Excision. -Attachement of dermatoscopic images -Specimen: 29 x 11 x 5 mm skin ellipse -Body Site: Back paralumbar left - -The skin sample, including the order form and the dermatoscopic image are sent to the laboratory. - -Matching FHIR questionnaire that corresponds to this specification: -[6-histopath.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-6-histopath.xml.html) -[6-histopath.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-6-histopath.json.html) diff --git a/input/pagecontent/casestudies-french.md b/input/pagecontent/casestudies-french.md deleted file mode 100644 index 5814dec2..00000000 --- a/input/pagecontent/casestudies-french.md +++ /dev/null @@ -1,86 +0,0 @@ - - -### Etude de cas 1 : Suspicion de thrombose veineuse profonde - -Un patient, Hans Guggindieluft, se présente au cabinet de groupe d'Olten du Dr méd. Marc Mustermann le 09.03.2016. Il s'identifie verbalement via ses données de base comme Hans Guggindieluft, 01.01.1981. Il rapporte une douleur peu claire dans la partie inférieure de la jambe gauche ainsi qu'une douleur respiratoire et une toux concomitantes. Le médecin procède à l'anamnèse et à l'examen physique et commande les paramètres de laboratoire suivants : - -* Numération sanguine, y compris le différentiel -* CRP -* D-dimère - -Le médecin effectue lui-même l'hémogramme et la détermination de la CRP à l'aide de diagnostics au point de service ; le diagnostic des D-dimères est prescrit en tant que diagnostic quantitatif dans un laboratoire expéditeur externe. Pour obtenir l'échantillon, une prise de sang est effectuée alors que le patient est allongé (1 tube EDTA, 2 tubes citrate de 5 ml). La commande est transmise au laboratoire externe et l'échantillon est envoyé au laboratoire d'expédition externe par courrier commandé par téléphone. Les résultats des diagnostics internes du point de service (numération sanguine et CRP) sont saisis dans la fiche de laboratoire du patient dans le logiciel du cabinet du médecin (manuellement ou via des interfaces électroniques installées localement). Une ordonnance du médecin est donc délivrée au patient pour l'auto-administration d'un agent antithrombotique. -Les résultats du laboratoire expéditeur arrivent électroniquement chez le médecin généraliste le soir même et sont également inscrits sur la fiche de laboratoire du patient. En utilisant le présent format d'échange, ce processus peut être entièrement automatisé. Après une demande téléphonique du médecin du laboratoire d'envoi en raison d'un résultat limite pour les D-dimères, l'information est donnée qu'une thrombose veineuse profonde ne peut être exclue dans cette situation au moyen des D-dimères et le patient est donc rappelé le lendemain pour qu'une échographie des jambes soit effectuée. - -Exemple FHIR correspondant qui répond à cette spécification : -[1-tvt.xml](https://github.com/hl7ch/ch-lab-order/tree/master/input/examples/bundle/1-tvt.xml) -[1-tvt.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-1-tvt.json.html) - -Comme il s'agit d'une thrombose veineuse primaire de la jambe, le Dr Eva Erlenmeier du laboratoire Pipette envoie un retour d'information au Dr Mustermann, lui recommandant d'effectuer un dépistage de la thrombophilie, qui comprend les analyses suivantes : -Quick, aPTT, fibrinogène, antithrombine (funct.), temps de thrombine I 2,5 NIH/ml, résistance APC, D-dimères, protéine C, (méthode aPTT), protéine S antigène. -Les analyses peuvent être effectuées directement à partir des échantillons des tubes de citrate envoyés. - -### Etude des cas 2: Suspicion de coqueluche - -Une mère se rend chez le médecin de famille Peter Presto du cabinet de groupe d'Olten avec son fils de 6 ans Emil Kummer, né le 5 mai 2014, car l'enfant tousse de plus en plus depuis quinze jours, avec des quintes de toux avec crampes, et a de la fièvre. La réceptionniste du médecin mesure la fièvre, prélève un échantillon de Sang au bout du doigt du fils, détermine la CRP et prépare un frottis sanguin. Le médecin soupçonne une infection virale, mais veut exclure la coqueluche, bien que l'enfant ait été vacciné contre cette maladie. Comme il est pressé par le temps en raison d'une urgence, il ne veut pas faire lui-même le prélèvement de gorge nécessaire, mais demande à la mère d'accompagner l'enfant au laboratoire voisin pour que le prélèvement soit effectué en toute tranquillité. -Il prépare un ordre de laboratoire pour effectuer une PCR coquelucheuse sur l'écouvillon de gorge de l'enfant et donne l'ordre à la mère. La mère elle-même n'est pas sûre d'avoir été vaccinée contre la coqueluche. Par conséquent, le médecin de famille Peter Presto lui administre immédiatement le vaccin contre la coqueluche et recommande de faire de même pour le père et les grands-parents de l'enfant. Entre-temps, l'AMP a examiné au microscope le frottis sanguin du fils et trouve beaucoup de lymphocytes réactifs, ce qui lui semble suspect. Elle a des doutes et interroge le médecin, qui donne l'ordre de remettre les frottis sanguins de l'enfant à la mère et de les faire examiner de plus près au laboratoire. -La mère arrive au laboratoire avec son fils, où l'ordre du médecin est d'abord d'établir l'identité du fils. Ensuite, un écouvillon pharyngé et une ponction veineuse cubitale droite sont prélevés sur l'enfant dans la salle de prélèvement sanguin du laboratoire et transmis au laboratoire avec les frottis sanguins et l'ordonnance d'examen du médecin. - -Questionnaire FHIR correspondant qui répond à cette spécification : - -[2-pertussis.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-2-pertussis.xml.html) -[2-pertussis.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-2-pertussis.json.html) - -### Etude des cas 3: Contrôle annuel gynécologique - -L'assistant du médecin du service de gynécologie du cabinet de groupe d'Olten, le Dr Peter Pap, prépare les consultations du lendemain. Comme le cabinet ne dispose que d'un laboratoire minimal, certains patients sont envoyés à la clinique externe du laboratoire Pipette voisin avant le rendez-vous, dont la jeune patiente Mme Marina Rubella, née le 8. 8. 1992. Dans son logiciel de cabinet, l'AMP prescrit les analyses standard convenues avec le laboratoire pour le contrôle gynécologique de 3 ans de la patiente Rubella. Ceci inclut également la prise de sang pour le sérologue pour d'éventuelles prescriptions de suivi. -Le laboratoire transmet les résultats au cabinet au plus tard 90 minutes après la prise de sang. Le Dr Pap prescrit les ordonnances suivantes lors de la consultation : - -* Cytologie cervicale gynécologique : Frottis cervical - si indiqué, la détection et le typage du HPV (virus du papillome humain) doivent également être effectués. - Matériel de prélèvement selon les instructions du laboratoire. - L'examen cytologique est réalisé dans le laboratoire Pipette. Le laboratoire Pipette ne réalise pas lui-même le typage. -* Bilan urinaire partiel (test Combur9) : effectué par l'AMP au cabinet : les paramètres suivants sont examinés : pH, leucocytes, érythrocytes, nitrites, protéines, glucose, cétones, urobilinogène, bilirubine (examens semi-quantitatifs, les résultats sont probablement saisis manuellement dans le système du laboratoire du cabinet). -* Bactériologie urinaire : matériel de prélèvement selon les instructions du laboratoire. -Bactérie générale, y compris les champignons à la pipette du laboratoire. -La transmission de l'ordonnance est déclenchée par l'AMP (heure de prélèvement). -* Ordre complémentaire "Dépistage avant grossesse" : Tous les tests peuvent être réalisés à partir du matériel (sérum, sang EDTA) prélevé au préalable en ambulatoire (anticorps anti-hépatite Bc, VIH 1+2 (Ak+p24), IgG rubéole, test de dépistage lues/syphilis). -* Mammographie : Commande pour l'Institut de radiologie Dr Curie. - -Questionnaire FHIR correspondant qui répond à cette spécification : -[3-gyn.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-3-gyn.xml.html) -[3-gyn.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-3-gyn.json.html) - -### Etude des cas 4: Septicémie suspectée - -La patiente Klebsiella Keller, né le 12. 12. 1975, se trouve depuis quelque temps à l'Hôpital cantonal. La nuit dernière, son état général s'est massivement détérioré. En raison d'une suspicion de septicémie, le médecin-chef responsable, le Dr Hans Hauser, ordonne un prélèvement de sang dans la matinée pour une hémoculture. 30 minutes plus tard, une autre hémoculture aérobie et une anaérobie sont prélevées, ainsi qu'un échantillon d'urine. -Les cinq échantillons sont ensuite traités dans la pipette du laboratoire externe. Là, les germes sont détectés dans tous les matériaux, puis identifiés par spectrométrie de masse. Les agents pathogènes "Klebsiella pneumoniae" et "Escherichia coli" ont été détectés dans les quatre flacons d'hémoculture, et la bactérie "Streptococcus mitis" a également été détectée dans un flacon d'aérobiose. Le germe identifié dans l'échantillon d'urine n'est normalement pas pathogène. -Un antibiogramme est réalisé pour les trois pathogènes détectés dans le sang. Celui-ci montre que les deux substances actives "amoxicilline+acide clavulanique" et "ceftriaxone" sont efficaces contre les trois germes. Le microbiologiste informe régulièrement le Dr Hans Hauser des différents résultats partiels. - -Questionnaire FHIR correspondant à cette spécification: -[4-sepsis.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-4-sepsis.xml.html) -[4-sepsis.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-4-sepsis.json.html) - -### Etude des cas 5: Commande collective "Surveillance biologique de la SUVA" - -Les entreprises qui travaillent avec des substances dangereuses pour la santé et dans lesquelles les employés sont exposés à des risques particuliers sont soumises à un dépistage de la santé au travail par la SUVA. La surveillance biologique est l'une des possibilités de contrôle. Elle permet d'évaluer l'exposition des travailleurs à des agents chimiques en déterminant les agents ou les métabolites dans le matériel biologique (par exemple l'urine). -L'AMV (Prévention Médicale du Travail) de la SUVA envoie au laboratoire une liste mensuelle avec les informations suivantes par entreprise (ordre collectif) : - -* Établissement (nom, adresse, numéro d'établissement). -* Nombre de salariés pour le suivi biologique -* Examens à effectuer (p.ex. arsenic, plomb, mercure, acide mandélique). -Les entreprises reçoivent de l'AMV une liste comprenant des étiquettes avec les employés concernés. Nous prenons ici le document d'un employé Beat Borer, né le 6. 6. 1986. Le laboratoire imprime les bons de commande avec le numéro de l'entreprise et envoie le nombre nécessaire de gobelets à urine et de bons de commande aux entreprises. Dans l'entreprise, les formulaires de commande et les gobelets à urine sont étiquetés avec les étiquettes fournies par l'AMV et remis aux employés. Les échantillons, y compris le bon de commande, sont envoyés de l'entreprise au laboratoire. - -[Surveillance biologique SUVA] - -Questionnaire FHIR correspondant à cette spécification: -[5-biol-monit.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-5-biol-monit.xml.html) -[5-biol-monit.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-5-biol-monit.json.html) - -### Étude de cas n° 6 : suspicion de mélanome, demande d'examen histopathologique - -Une patiente de 45 ans s'est présentée pour un examen régulier de la peau et cette lésion a été observée : Naevus de jonction composé d'une zone séborrhéique à l'extrémité supérieure et d'un réseau atypique constitué de nombreux points, structures, etc. distincts, suggérant une implication mélanocytaire. Excision. Joindre les images dermatoscopiques Spécimen : Ellipse cutanée de 29 x 11 x 5 mm Site corporel : Dos paralombaire gauche - -L'échantillon de peau, le formulaire de commande et l'image dermatoscopique sont envoyés au laboratoire. - -Questionnaire FHIR correspondant à cette spécification: -[6-histopath.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-6-histopath.xml.html) -[6-histopath.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-6-histopath.json.html) diff --git a/input/pagecontent/casestudies-german.md b/input/pagecontent/casestudies-german.md deleted file mode 100644 index 13538a99..00000000 --- a/input/pagecontent/casestudies-german.md +++ /dev/null @@ -1,85 +0,0 @@ -### Fallbeispiel 1: Verdacht auf tiefe Venenthrombose - -Ein Patient, Hans Guggindieluft, erscheint am 09.03.2016 in der Gruppenpraxis Olten bei Dr. med. Marc Mustermann. Er identifiziert sich mündlich über seine Stammdaten als Hans Guggindieluft, 01.01.1981. Er berichtet über unklare Beinschmerzen im linken Unterschenkel sowie gleichzeitig aufgetretene atemabhängige Schmerzen und Husten. Der Arzt führt die Anamnese und körperliche Untersuchung durch und verordnet folgende Laborparameter: - -* Blutbild inkl. Differenzierung -* CRP -* D-Dimer - -Der Arzt führt selber das Blutbild und die CRP-Bestimmung mittels Point of care Diagnostik durch, die D-Dimer-Diagnostik wird als Quantitative Diagnostik in einem externen Einsendelabor verordnet. Zur Gewinnung der Probe wird eine Blutentnahme im Liegen durchgeführt (1 EDTA-Röhrchen, 2 Citrat-Röhrchen zu 5 ml). Der Auftrag wird an das externe Labor übermittelt und die Probe wird mittels telefonisch geordertem Kurier in das externe Versandlabor geschickt. Die Resultate der internen Point of Care-Diagnostik (Blutbild und CRP) werden im Laborblatt des Patienten in der Arztpraxis-Software eingetragen (händisch oder über lokal installierte elektronische Schnittstellen). Es erfolgt daher eine Verordnung des Arztes an den Patienten zur Selbstverabreichung eines thrombosehemmenden Mittels. -Die Resultate des Einsendelabors treffen am gleichen Abend elektronisch beim Hausarzt ein und werden ebenfalls im Laborblatt des Patienten eingetragen. Durch den Einsatz des vorliegenden Austauschformats kann dieser Prozess vollautomatisch erfolgen. Nach telefonischer Rückfrage des Arztes beim Einsendelabor auf Grund eines grenzwertigen D-Dimer-Befundes erfolgt die Auskunft, dass mittels D-Dimer in dieser Situation eine tiefe Venenthrombose nicht ausgeschlossen werden kann und es erfolgt daher eine telefonische Wiedereinbestellung des Patienten am nächsten Tag zur Durchführung einer Sonographie der Beine. - -Dazu passendes FHIR Formular, welches dieser Spezifikation entspricht: -[1-tvt.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-1-tvt.xml.html) -[1-tvt.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-1-tvt.json.html) - -Da es sich um eine primäre Beinvenenthrombose handelt, sendet Frau Dr. Eva Erlenmeier vom Labor Pipette ein Feedback an Dr. Mustermann, mit der Empfehlung, ein Thrombophilie-Screening durchzuführen, welches folgende Analysen enthält: -Quick, aPTT, Fibrinogen, Antithrombin (funkt.), Thrombinzeit I 2.5 NIH/ml, APC Resistenz, D-Dimere, Protein C, (aPTT Methode), Protein S-Antigen -Die Analysen können direkt von den mitgeschickten Proben der Citrat-Röhrchen erfolgen. - -### Fallbeispiel 2: Verdacht auf Keuchhusten - -TODO: Zu diesem Fallbeispiel befinden sich im Whitepaper[1], Anhang 8.7 konkrete Beispieldokumente. Die « Abbildung 2 » im Whitepaper[1] zeigt das zu diesem Fallbeispiel gehörende Use Case Diagramm. - -Eine Mutter sucht mit ihrem 6-jährigen Sohn Emil Kummer, geb. 5. Mai 2014, den Hausarzt Peter Presto der Gruppenpraxis Olten auf, weil das Kind seit zwei Wochen zunehmend hustet, mit krampfartigen Hustenanfällen, und Fieber hat. Die MPA der Arztpraxis misst das Fieber, macht bereits eine Fingerkuppen-Blutentnahme beim Sohn, bestimmt das CRP und fertigt einen Blutausstrich an. Der Arzt vermutet einen viralen Infekt, möchte aber Keuchhusten ausschliessen, obwohl das Kind dagegen geimpft ist. Da er wegen eines Notfalles unter Zeitdruck ist, möchte er den dazu nötigen Rachenabstrich nicht selbst durchführen, sondern bittet die Mutter, das Kind ins nahegelegene Labor zu begleiten, um den Abstrich in Ruhe anfertigen zu lassen. -Er erstellt einen Laborauftrag zur Durchführung einer Pertussis-PCR im Rachenabstrich des Kindes und gibt den Auftrag der Mutter mit. Die Mutter selbst ist nicht sicher, ob sie selbst gegen Keuchhusten geimpft ist. Demzufolge nimmt der Hausarzt Peter Presto die Pertussis-Impfung bei ihr gleich vor und empfiehlt, dasselbe beim Kindsvater und bei den Grosseltern durchzuführen. Die MPA hat inzwischen den Blutausstrich des Sohnes im Mikroskop angeschaut und findet ausgesprochen viele reaktive Lymphozyten, die ihr verdächtig erscheinen. Sie ist unsicher und fragt den Arzt, welcher den Auftrag gibt, die Blutausstriche des Kindes der Mutter mitzugeben und ebenfalls im Labor genauer untersuchen zu lassen. -Die Mutter findet sich mit ihrem Sohn im Labor ein, wo auf Grund des Untersuchungsauftrages des Arztes vorerst die Identität des Sohnes festgestellt wird. Anschliessend wird im Blutentnahmeraum des Labors beim Kind ein Rachenabstrich sowie eine Venenpunktion cubital rechts durchgeführt und zusammen mit den mitgebrachten Blutausstrichen und dem Untersuchungsauftrag des Arztes ins Labor weitergegeben. - -Dazu passendes FHIR Formular, welches dieser Spezifikation entspricht: -[2-pertussis.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-2-pertussis.xml.html) -[2-pertussis.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-2-pertussis.json.html) - -### Fallbeispiel 3: Gynäkologische Jahreskontrolle - -Die MPA der Gynäkologie in der Gruppenpraxis Olten, Dr. Peter Pap bereitet die Konsultationen des nächsten Tages vor. Da die Praxis nur ein minimales eigenes Labor betreibt, werden gewisse Patientinnen vor dem Besuchstermin ins nahe gelegene Ambulatorium des Labors Pipette geschickt, so auch die junge Patientin Frau Marina Rubella, geb. 8. 8. 1992. Die MPA verordnet in ihrer Praxis-Software für die Patientin Rubella die mit dem Labor vereinbarten Standard-Analysen für die gynäkologische 3-Jahreskontrolle. Dazu gehört auch die Blutentnahme für die Serothek für allfällige Nachverordnungen. -Das Labor übermittelt die Resultate spätestens 90 Minuten nach der Blutentnahme in die Praxis. Dr. Pap verordnet während der Konsultation folgende Aufträge: - -* Gynäkologische Zervix Zytologie: Pap-Abstrich - falls indiziert soll auch der Nachweis und die Typisierung von HPV (Humane Papillomaviren) durchgeführt werden. - Entnahmematerial gemäss Angaben des Labors. - Die zytologische Untersuchung wird im Labor Pipette durchgeführt. Die allfällige Typisierung führt das Labor Pipette nicht selber durch. -* Urin-Teilstatus (Combur9 Test): Wird durch die MPA in der Praxis durchgeführt: folgende Parameter werden untersucht: ph, Leukozyten, Erythrozyten, Nitrit, Protein, Glucose, Ketone, Urobilinogen, Bilirubin (halbquantitative Untersuchungen, Resultate werden wahrscheinlich von Hand ins Praxis-Laborsystem eingetragen) -* Urin-Bakteriologie: Entnahmematerial gemäss Angaben des Labors -Allgemeine Bakt, inkl. Sprosspilze ans Labor Pipette -Die Übermittlung des Auftrags wird durch die MPA ausgelöst (Entnahmezeitpunkt) -* Nachverordnung "Screening vor Schwangerschaft": Alle Untersuchungen können aus den vorgängig im Ambulatorium entnommenen Materialien (Serum, EDTA-Blut) durchgeführt werden (Hepatitis-Bc Antikörper, HIV 1+2 (Ak+p24), Röteln IgG, Lues-/Syphilis-Suchtest) -* Mammographie: Auftrag für das Röntgeninstitut Dr. Curie, gemäss CH RAD-Order - -Dazu passendes FHIR Formular, welches dieser Spezifikation entspricht: -[3-gyn.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-3-gyn.xml.html) -[3-gyn.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-3-gyn.json.html) - -### Fallbeispiel 4: Verdacht auf eine Sepsis - -Die Patientin Klebsiella Keller, geb. 12. 12. 1975, ist schon seit längerer Zeit im Kantonsspital. In der vergangenen Nacht hat sich ihr Allgemeinzustand massiv verschlechtert. Da ein Verdacht auf eine Sepsis besteht, ordnet der zuständige Oberarzt, Dr. Hans Hauser, an, dass ihr am Morgen Blut für eine Blutkultur entnommen wird. 30 Minuten später wird nochmals eine aerobe und eine anaerobe Blutkultur angelegt, sowie eine Urinprobe gewonnen. -Alle fünf Proben werden im externen Labor Pipette weiter bearbeitet. Dort werden in allen Materialien Keime nachgewiesen und dann mittels Massenspektrometrie identifiziert. In den vier Blutkulturflaschen konnten die Erreger „Klebsiella pneumoniae“ und „Escherichia coli“ nachgewiesen werden, in einer aeroben Flasche noch zusätzlich das Bakterium „Streptococcus mitis“. Der in der Urinprobe identifizierte Keim ist normalerweise nicht pathogen. -Von allen drei im Blut nachgewiesenen Erreger wird ein Antibiogramm erstellt. Dabei zeigt sich, dass die beiden Wirkstoffe “Amoxicillin+Clavulansäure“ und „Ceftriaxon“ bei allen drei Keimen wirksam sind. Der Mikrobiologe informiert Dr. Hans Hauser regelmässig über die verschiedenen Teilresultate. - -Dazu passendes FHIR Formular, welches dieser Spezifikation entspricht: -[4-sepsis.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-4-sepsis.xml.html) -[4-sepsis.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-4-sepsis.json.html) - -### Fallbeispiel 5: Sammelauftrag „Biologisches Monitoring SUVA“ - -Betriebe, welche mit gesundheitsgefährdenden Stoffen arbeiten und in denen Arbeitnehmende speziellen Risiken ausgesetzt sind, werden von der SUVA der arbeitsmedizinischen Vorsorge unterstellt. Eine Kontrollmöglichkeit ist die Biologische Überwachung. Diese beurteilt die Exposition von Arbeitnehmenden gegenüber chemischen Arbeitsstoffen durch die Bestimmung der Arbeitsstoffe oder von Metaboliten (Umwandlungsprodukten) im biologischen Material (z.B. Urin). -Die Arbeitsmedizinische Vorsorge (AMV) der SUVA sendet dem Labor monatlich eine Liste mit folgenden Informationen pro Betrieb (Sammelauftrag): - -* Betrieb (Name, Adresse, Betriebs-Nummer) -* Anzahl Arbeitnehmende für das Biologische Monitoring -* durchzuführende Untersuchungen (z.B. Arsen, Blei, Quecksilber, Mandelsäure) -Die Betriebe erhalten von der AMV eine Liste inkl. Etiketten mit den betroffenen Arbeitnehmenden. Hier nehmen wir als Beispiel für einen Arbeitnehmer Beat Borer, geb. 6. 6. 1986. Das Labor bedruckt die Auftragsformulare mit der Betriebsnummer und sendet den Betrieben die notwendige Anzahl Urinbecher und Auftragsformulare zu. Im Betrieb werden Auftragsformulare und Urinbecher mit den von der AMV gelieferten Etiketten versehen und an die Arbeitnehmenden abgegeben. Die Proben inkl. Auftragsformular werden vom Betrieb ans Labor gesendet. - -[Biologisches Monitoring SUVA](https://www.suva.ch/de-CH/material/Factsheets/biologisches-monitoring-und-biologische-arbeitsstofftoleranzwerte) - -Dazu passendes FHIR Formular, welches dieser Spezifikation entspricht: -[5-biol-monit.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-5-biol-monit.xml.html) -[5-biol-monit.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-5-biol-monit.json.html) - -### Fallbeispiel 6: Verdacht auf Melanom, Anordnung einer histopathologischen Untersuchung - -Eine 45-jährige Patientin kam zu ihrer regelmäßigen Hautuntersuchung und es wurde diese Läsion festgestellt: Verbindungsnävi, bestehend aus einem seborrhoischen Bereich am oberen Ende und einem atypischen Netzwerk aus vielen einzelnen Punkten, Strukturen usw., was auf eine melanozytäre Beteiligung hindeutet. Exzision. Beifügung dermatoskopischer Bilder Präparat: 29 x 11 x 5 mm Hautellipse Körperstelle: Rücken paralumbar links - -Die Hautprobe wird zusammen mit dem Auftragsformular und dem dermatoskopischen Bild an das Labor gesandt. - -Passende FHIR-Formular, das dieser Spezifikation entspricht: -[6-histopath.xml](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-6-histopath.xml.html) -[6-histopath.json](https://fhir.ch/ig/ch-lab-order/Questionnaire-6-histopath.json.html)