diff --git a/.lintr b/.lintr index fdfcde877..be078509b 100644 --- a/.lintr +++ b/.lintr @@ -1,9 +1,9 @@ linters: linters_with_defaults( - cyclocomp_linter = NULL, commented_code_linter = NULL, line_length_linter = NULL, object_name_linter = NULL, - seq_linter = NULL + seq_linter = NULL, + return_linter = NULL ) exclusions: list( diff --git a/DESCRIPTION b/DESCRIPTION index 5b259721b..b8a15cadf 100644 --- a/DESCRIPTION +++ b/DESCRIPTION @@ -29,13 +29,13 @@ Description: plot networks. Depends: R (>= 3.1), - ggplot2 (>= 3.4.4) + ggplot2 (>= 3.5.2) Imports: dplyr (>= 1.0.0), tidyr (>= 1.3.0), grDevices, grid, - ggstats, + ggstats (>= 0.9.0), gtable (>= 0.2.0), lifecycle, plyr (>= 1.8.3), @@ -71,7 +71,7 @@ Suggests: emmeans, vdiffr Roxygen: list(markdown = TRUE) -RoxygenNote: 7.3.1 +RoxygenNote: 7.3.2 SystemRequirements: openssl Encoding: UTF-8 Language: en-US diff --git a/NEWS.md b/NEWS.md index 12445271a..4861fb906 100644 --- a/NEWS.md +++ b/NEWS.md @@ -1,8 +1,12 @@ # GGally (development version) +* Prepare GGally for ggplot2 v4 (Thank you @teunbrand! #528) + + # GGally 2.2.1 -* Fix compatibility with ggplot2 3.5.0 (@teunbrand, #481) +* Fix compatibility with ggplot2 3.5.0 (Thank you @teunbrand! #481) + # GGally 2.2.0 @@ -28,6 +32,7 @@ * Replace `ggplot2` usage of `*_guide = FALSE` with `*_guide = "none"` (@larmarange, #418) * Require `network >= 1.17.1` (#418) + # GGally 2.1.1 ### Bug fixes @@ -37,6 +42,7 @@ * Avoid an error when tidiers do not return p-values. (@larmarange, #400) * Suggest `emmeans` to allow `ggcoef()` example to execute. (#407) + # GGally 2.1.0 ### Breaking changes diff --git a/R/gg-plots.R b/R/gg-plots.R index 588722f29..06c8bca8a 100644 --- a/R/gg-plots.R +++ b/R/gg-plots.R @@ -1447,7 +1447,7 @@ ggally_count <- function(data, mapping, ...) { args <- list(...) if (!"fill" %in% names(args)) { if (is.null(mapping$fill)) { - args$fill <- GeomRect$default_aes$fill + args$fill <- get_geom_defaults(GeomRect)$fill } } diff --git a/R/ggally_cross.R b/R/ggally_cross.R index b60a098e9..a3f7fa8ea 100644 --- a/R/ggally_cross.R +++ b/R/ggally_cross.R @@ -73,7 +73,7 @@ ggally_cross <- function(data, mapping, ..., scale_max_size = 20, geom_text_args args$shape <- 22 } if (is.null(mapping$fill) && is.null(args$fill)) { - args$fill <- GeomRect$default_aes$fill + args$fill <- get_geom_defaults(GeomRect)$fill } args$keep.zero.cells <- FALSE diff --git a/R/ggcoef.R b/R/ggcoef.R index efe9e5a40..c66b207b4 100644 --- a/R/ggcoef.R +++ b/R/ggcoef.R @@ -117,10 +117,10 @@ ggcoef <- function( } } if (conf.int && "conf.low" %in% names(x) && "conf.high" %in% names(x)) { - p <- p + geom_errorbarh( + p <- p + geom_errorbar( aes(xmin = !!as.name("conf.low"), xmax = !!as.name("conf.high")), color = errorbar_color, - height = errorbar_height, + width = errorbar_height, linetype = errorbar_linetype, linewidth = errorbar_size ) diff --git a/R/gglyph.R b/R/gglyph.R index 0b2e3272d..4bd8eeb33 100644 --- a/R/gglyph.R +++ b/R/gglyph.R @@ -47,12 +47,12 @@ glyphs <- function( x_scale = identity) { data$gid <- interaction(data[[x_major]], data[[y_major]], drop = TRUE) - if (is.rel(width)) { + if (inherits(width, "rel")) { width <- resolution(data[[x_major]], zero = FALSE) * unclass(width) message("Using width ", format(width, digits = 3)) } - if (is.rel(height)) { + if (inherits(height, "rel")) { height <- resolution(data[[y_major]], zero = FALSE) * unclass(height) message("Using height ", format(height, digits = 3)) } @@ -207,36 +207,6 @@ print.glyphplot <- function(x, ...) { # cat("\n") } - -# Relative dimensions -------------------------------------------------------- - -# Relative dimensions -# -# @param x numeric value between 0 and 1 -# rel <- function(x) { -# structure(x, class = "rel") -# } -# @export -# rel <- ggplot2::rel - -# @rdname rel -# @param ... ignored -# print.rel <- function(x, ...) { -# print(noquote(paste(x, " *", sep = ""))) -# } -## works even though it is not exported -# @export -# ggplot2::print.rel - -# @rdname rel -# is.rel <- function(x) { -# inherits(x, "rel") -# } -## only used internally. and ggplot2 has this exported -# @export -# ggplot2:::is.rel -is.rel <- ggplot2:::is.rel - # Rescaling functions -------------------------------------------------------- #' Rescaling functions diff --git a/R/ggmatrix.R b/R/ggmatrix.R index 2407ba8ba..68ed7e091 100644 --- a/R/ggmatrix.R +++ b/R/ggmatrix.R @@ -107,7 +107,7 @@ ggmatrix <- function( byrow = byrow ) - attributes(plotMatrix)$class <- c("gg", "ggmatrix") + attributes(plotMatrix)$class <- c("ggmatrix", "gg") plotMatrix } diff --git a/R/ggmatrix_gtable.R b/R/ggmatrix_gtable.R index c63631a27..048d1642c 100644 --- a/R/ggmatrix_gtable.R +++ b/R/ggmatrix_gtable.R @@ -218,7 +218,7 @@ ggmatrix_gtable <- function( } # if it's not a ggplot2 obj, insert it and pray it works - if (!is.ggplot(p)) { + if (!is_ggplot(p)) { pmg$grobs[[grob_pos_panel]] <- p next } diff --git a/R/ggpairs_add.R b/R/ggpairs_add.R index c72d70f31..75340cfc6 100644 --- a/R/ggpairs_add.R +++ b/R/ggpairs_add.R @@ -24,7 +24,6 @@ #' @param e2 A component to add to \code{e1} #' #' @export -#' @seealso [ggplot2::+.gg] and [ggplot2::theme()] #' @method + gg #' @rdname gg-add #' @examples @@ -44,19 +43,24 @@ #' p_(pm + extra) "+.gg" <- function(e1, e2) { if (!is.ggmatrix(e1)) { - return(e1 %+% e2) + if ("add_gg" %in% getNamespaceExports("ggplot2")) { + fn <- utils::getFromNamespace("add_gg", "ggplot2") + } else { + fn <- ggplot2::`%+%` + } + return(fn(e1, e2)) } if (is.null(e1$gg)) { e1$gg <- list() } - if (inherits(e2, "labels")) { + if (inherits(e2, c("labels", "ggplot2::labels"))) { add_labels_to_ggmatrix(e1, e2) - } else if (is.theme(e2)) { + } else if (is_theme(e2)) { add_theme_to_ggmatrix(e1, e2) } else if (is.list(e2)) { add_list_to_ggmatrix(e1, e2) - } else if (is.ggproto(e2)) { + } else if (is_ggproto(e2)) { add_to_ggmatrix(e1, e2) } else { stop( @@ -97,7 +101,7 @@ add_labels_to_ggmatrix <- function(e1, e2) { if (length(non_ggmatrix_labels) > 0) { if (is.null(e1$gg$labs)) { - e1$gg$labs <- structure(list(), class = "labels") + e1$gg$labs <- labs() } e1$gg$labs[non_ggmatrix_labels] <- e2[non_ggmatrix_labels] } @@ -114,7 +118,7 @@ add_theme_to_ggmatrix <- function(e1, e2) { e1$gg$theme <- e2 } else { # calls ggplot2 add method and stores the result in gg - e1$gg$theme <- e1$gg$theme %+% e2 + e1$gg$theme <- e1$gg$theme + e2 } e1 } @@ -148,7 +152,7 @@ add_to_ggmatrix <- function( if (!is.ggmatrix(e1)) { stop("e1 should be a ggmatrix.") } - if (!is.ggproto(e2)) { + if (!is_ggproto(e2)) { stop("e2 should be a ggproto object.") } diff --git a/R/ggpairs_getput.R b/R/ggpairs_getput.R index ff129ef20..09f66c8d0 100644 --- a/R/ggpairs_getput.R +++ b/R/ggpairs_getput.R @@ -84,7 +84,7 @@ getPlot <- function(pm, i, j) { if (is.null(plotObj)) { p <- ggally_blank() } else { - if (ggplot2::is.ggplot(plotObj)) { + if (ggplot2::is_ggplot(plotObj)) { p <- plotObj } else if (inherits(plotObj, "ggmatrix_plot_obj")) { fn <- plotObj$fn diff --git a/R/ggpairs_internal_plots.R b/R/ggpairs_internal_plots.R index 9ad10d7c9..ae735f5d8 100644 --- a/R/ggpairs_internal_plots.R +++ b/R/ggpairs_internal_plots.R @@ -261,7 +261,7 @@ str.ggmatrix <- function(object, ..., raw = FALSE) { "'str(", objName, ", raw = TRUE)'\n\n" )) obj$plots <- lapply(obj$plots, function(plotObj) { - if (ggplot2::is.ggplot(plotObj)) { + if (ggplot2::is_ggplot(plotObj)) { str_c("PM; ggplot2 object; mapping: ", mapping_as_string(plotObj$mapping)) } else if (inherits(plotObj, "ggmatrix_plot_obj")) { as.character(plotObj) diff --git a/man/gg-add.Rd b/man/gg-add.Rd index 7c7e66974..8698bbe72 100644 --- a/man/gg-add.Rd +++ b/man/gg-add.Rd @@ -82,7 +82,5 @@ p_(add_to_ggmatrix( )) } \seealso{ -\link[ggplot2:gg-add]{ggplot2::+.gg} and \code{\link[ggplot2:theme]{ggplot2::theme()}} - \code{\link{ggmatrix_location}} } diff --git a/man/reexports.Rd b/man/reexports.Rd index 9f1328aee..2c1fbfc29 100644 --- a/man/reexports.Rd +++ b/man/reexports.Rd @@ -23,6 +23,6 @@ These objects are imported from other packages. Follow the links below to see their documentation. \describe{ - \item{ggstats}{\code{\link[ggstats:geom_stripped_rows]{geom_stripped_cols}}, \code{\link[ggstats]{geom_stripped_rows}}, \code{\link[ggstats:ggcoef_model]{ggcoef_compare}}, \code{\link[ggstats]{ggcoef_model}}, \code{\link[ggstats:ggcoef_model]{ggcoef_multinom}}, \code{\link[ggstats:ggcoef_model]{ggcoef_plot}}, \code{\link[ggstats]{signif_stars}}, \code{\link[ggstats]{stat_cross}}, \code{\link[ggstats]{stat_prop}}, \code{\link[ggstats]{stat_weighted_mean}}, \code{\link[ggstats:stat_cross]{StatCross}}, \code{\link[ggstats:stat_prop]{StatProp}}, \code{\link[ggstats:stat_weighted_mean]{StatWeightedMean}}} + \item{ggstats}{\code{\link[ggstats:geom_stripped_rows]{geom_stripped_cols}}, \code{\link[ggstats]{geom_stripped_rows}}, \code{\link[ggstats:ggcoef_model]{ggcoef_compare}}, \code{\link[ggstats]{ggcoef_model}}, \code{\link[ggstats:ggcoef_multicomponents]{ggcoef_multinom}}, \code{\link[ggstats:ggcoef_model]{ggcoef_plot}}, \code{\link[ggstats]{signif_stars}}, \code{\link[ggstats]{stat_cross}}, \code{\link[ggstats]{stat_prop}}, \code{\link[ggstats]{stat_weighted_mean}}, \code{\link[ggstats:stat_cross]{StatCross}}, \code{\link[ggstats:stat_prop]{StatProp}}, \code{\link[ggstats:stat_weighted_mean]{StatWeightedMean}}} }} diff --git a/tests/testthat/_snaps/gg-plots/rescale-false.svg b/tests/testthat/_snaps/gg-plots/rescale-false.svg index 3632f025b..4262de7b5 100644 --- a/tests/testthat/_snaps/gg-plots/rescale-false.svg +++ b/tests/testthat/_snaps/gg-plots/rescale-false.svg @@ -27,14 +27,14 @@ - - - - - - - - + + + + + + + + diff --git a/tests/testthat/_snaps/gg-plots/rescale-true.svg b/tests/testthat/_snaps/gg-plots/rescale-true.svg index 3db37e58b..4fd2a62bc 100644 --- a/tests/testthat/_snaps/gg-plots/rescale-true.svg +++ b/tests/testthat/_snaps/gg-plots/rescale-true.svg @@ -27,10 +27,10 @@ - - - - + + + + diff --git a/tests/testthat/_snaps/gglegend/custom.svg b/tests/testthat/_snaps/gglegend/custom.svg index 2e31a9200..162a9f2a0 100644 --- a/tests/testthat/_snaps/gglegend/custom.svg +++ b/tests/testthat/_snaps/gglegend/custom.svg @@ -18,16 +18,16 @@ - + Species - - - - - - -setosa -versicolor -virginica + + + + + + +setosa +versicolor +virginica diff --git a/tests/testthat/_snaps/gglegend/internal-legend.svg b/tests/testthat/_snaps/gglegend/internal-legend.svg index c52c6cb69..d3f2eba6f 100644 --- a/tests/testthat/_snaps/gglegend/internal-legend.svg +++ b/tests/testthat/_snaps/gglegend/internal-legend.svg @@ -27,27 +27,27 @@ - - - + + + - - - + + + - - - - - - + + + + + + @@ -246,17 +246,17 @@ - + Species - - - - - - -setosa -versicolor -virginica + + + + + + +setosa +versicolor +virginica @@ -269,29 +269,29 @@ - - - + + + - - + + - - - - - - + + + + + + @@ -363,13 +363,13 @@ 4.0 4.5 0.0 -0.4 -0.8 -1.2 +0.4 +0.8 +1.2 - - - + + + 2.0 2.5 3.0 diff --git a/tests/testthat/_snaps/gglegend/legend-pm.svg b/tests/testthat/_snaps/gglegend/legend-pm.svg index a8fa70285..09e3bc3bf 100644 --- a/tests/testthat/_snaps/gglegend/legend-pm.svg +++ b/tests/testthat/_snaps/gglegend/legend-pm.svg @@ -27,27 +27,27 @@ - - - + + + - - - + + + - - - - - - + + + + + + @@ -269,29 +269,29 @@ - - - + + + - - + + - - - - - - + + + + + + @@ -363,13 +363,13 @@ 4.0 4.5 0.0 -0.4 -0.8 -1.2 +0.4 +0.8 +1.2 - - - + + + 2.0 2.5 3.0 diff --git a/tests/testthat/_snaps/gglegend/points.svg b/tests/testthat/_snaps/gglegend/points.svg index f2ff0fb15..d5c8a1c7e 100644 --- a/tests/testthat/_snaps/gglegend/points.svg +++ b/tests/testthat/_snaps/gglegend/points.svg @@ -18,16 +18,16 @@ - + Species - - - - - - -setosa -versicolor -virginica + + + + + + +setosa +versicolor +virginica diff --git a/tests/testthat/_snaps/gglegend/pos-left.svg b/tests/testthat/_snaps/gglegend/pos-left.svg index 7500504c2..f40d7830a 100644 --- a/tests/testthat/_snaps/gglegend/pos-left.svg +++ b/tests/testthat/_snaps/gglegend/pos-left.svg @@ -18,22 +18,22 @@ - + cut - - - - - - - - - - -Fair -Good -Very Good -Premium -Ideal + + + + + + + + + + +Fair +Good +Very Good +Premium +Ideal diff --git a/tests/testthat/_snaps/gglegend/pos-right.svg b/tests/testthat/_snaps/gglegend/pos-right.svg index 7500504c2..f40d7830a 100644 --- a/tests/testthat/_snaps/gglegend/pos-right.svg +++ b/tests/testthat/_snaps/gglegend/pos-right.svg @@ -18,22 +18,22 @@ - + cut - - - - - - - - - - -Fair -Good -Very Good -Premium -Ideal + + + + + + + + + + +Fair +Good +Very Good +Premium +Ideal diff --git a/tests/testthat/_snaps/ggmatrix/blank-1-2-2-1.svg b/tests/testthat/_snaps/ggmatrix/blank-1-2-2-1.svg index 3437c43ad..ef5b52159 100644 --- a/tests/testthat/_snaps/ggmatrix/blank-1-2-2-1.svg +++ b/tests/testthat/_snaps/ggmatrix/blank-1-2-2-1.svg @@ -27,24 +27,24 @@ - - - + + + - - + + - - + + @@ -77,24 +77,24 @@ - - - - + + + + - - - + + + - - + + @@ -154,10 +154,10 @@ 7.5 10.0 0.00 -0.02 -0.04 +0.02 +0.04 - - + + diff --git a/tests/testthat/_snaps/ggmatrix/blank-1-2.svg b/tests/testthat/_snaps/ggmatrix/blank-1-2.svg index a8256324e..7f80ad1a7 100644 --- a/tests/testthat/_snaps/ggmatrix/blank-1-2.svg +++ b/tests/testthat/_snaps/ggmatrix/blank-1-2.svg @@ -27,24 +27,24 @@ - - - + + + - - + + - - + + @@ -344,24 +344,24 @@ - - - - + + + + - - - + + + - - + + @@ -431,11 +431,11 @@ 7.5 10.0 0.00 -0.02 -0.04 +0.02 +0.04 - - + + 2.5 5.0 7.5 diff --git a/tests/testthat/_snaps/ggmatrix/expression-labels.svg b/tests/testthat/_snaps/ggmatrix/expression-labels.svg index bf27f519f..6d0b201b3 100644 --- a/tests/testthat/_snaps/ggmatrix/expression-labels.svg +++ b/tests/testthat/_snaps/ggmatrix/expression-labels.svg @@ -27,24 +27,24 @@ - - - + + + - - + + - - + + @@ -352,24 +352,24 @@ - - - - + + + + - - - + + + - - + + @@ -449,11 +449,11 @@ 7.5 10.0 0.00 -0.02 -0.04 +0.02 +0.04 - - + + 2.5 5.0 7.5 diff --git a/tests/testthat/_snaps/ggmatrix/proportions.svg b/tests/testthat/_snaps/ggmatrix/proportions.svg index 2bad00e47..efc9b0971 100644 --- a/tests/testthat/_snaps/ggmatrix/proportions.svg +++ b/tests/testthat/_snaps/ggmatrix/proportions.svg @@ -27,27 +27,27 @@ - - - + + + - - - + + + - - - - - - + + + + + + @@ -269,9 +269,9 @@ - - - + + + @@ -279,14 +279,14 @@ - - - - - - - - + + + + + + + + @@ -338,19 +338,19 @@ 7 8 - - + + 0.0 -0.5 -1.0 +0.5 +1.0 0.0 -0.4 -0.8 -1.2 +0.4 +0.8 +1.2 - - - + + + 2.0 2.5 3.0 diff --git a/tests/testthat/_snaps/ggscatmat/flea-color.svg b/tests/testthat/_snaps/ggscatmat/flea-color.svg index 85ca5198a..b0ed1b320 100644 --- a/tests/testthat/_snaps/ggscatmat/flea-color.svg +++ b/tests/testthat/_snaps/ggscatmat/flea-color.svg @@ -54,9 +54,9 @@ - - - + + + @@ -314,9 +314,9 @@ - - - + + + @@ -497,9 +497,9 @@ - - - + + + diff --git a/tests/testthat/_snaps/ggscatmat/flea-pearson.svg b/tests/testthat/_snaps/ggscatmat/flea-pearson.svg index d59324de3..47f258e8a 100644 --- a/tests/testthat/_snaps/ggscatmat/flea-pearson.svg +++ b/tests/testthat/_snaps/ggscatmat/flea-pearson.svg @@ -36,26 +36,26 @@ - - - + + + - - - - + + + + - + @@ -167,25 +167,25 @@ - - - + + + - - - - + + + + -0.03 +0.03 @@ -212,7 +212,7 @@ - + @@ -277,15 +277,15 @@ 120 130 140 -125 -150 -175 -200 +125 +150 +175 +200 225 - - - - + + + + 110 120 diff --git a/tests/testthat/_snaps/ggscatmat/flea-rsquare.svg b/tests/testthat/_snaps/ggscatmat/flea-rsquare.svg index fcc379de0..0b10420e2 100644 --- a/tests/testthat/_snaps/ggscatmat/flea-rsquare.svg +++ b/tests/testthat/_snaps/ggscatmat/flea-rsquare.svg @@ -36,26 +36,26 @@ - 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- + + - - -tip + + +tip - - + + - - -sex + + +sex - - + + - - -smoker + + +smoker - - - - - -10 -20 -30 -40 -50 - - - - -2.5 -5.0 -7.5 -10.0 - - -Female -Male -10 -20 -30 -40 -50 - - - - - -2.5 -5.0 -7.5 -10.0 - - - - -Female - -Male - -No - -Yes - + + + + + +10 +20 +30 +40 +50 + + + + +2.5 +5.0 +7.5 +10.0 + + +Female +Male +10 +20 +30 +40 +50 + + + + + +2.5 +5.0 +7.5 +10.0 + + + + +Female + +Male + +No + +Yes + types = c(cont = density, combo = box, discrete = colbar) diff --git a/tests/testthat/_snaps/zzz_ggpairs/ggduo-points-dot-count-bardiag-countdiag.svg b/tests/testthat/_snaps/zzz_ggpairs/ggduo-points-dot-count-bardiag-countdiag.svg index 6fe1f008d..f32a4d0ac 100644 --- a/tests/testthat/_snaps/zzz_ggpairs/ggduo-points-dot-count-bardiag-countdiag.svg +++ b/tests/testthat/_snaps/zzz_ggpairs/ggduo-points-dot-count-bardiag-countdiag.svg @@ -21,3079 +21,3079 @@ - - + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 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+ - - + + - - -total_bill + + +total_bill - - + + - - -tip + + +tip - - + + - - -sex + + +sex - - + + - - -smoker + + +smoker - - + + - - -total_bill + + +total_bill - - + + - - -tip + + +tip - - + + - - -sex + + +sex - - + + - - -smoker + + +smoker - - - - - -10 -20 -30 -40 -50 - - - - -2.5 -5.0 -7.5 -10.0 - - -Female -Male - - -No -Yes -2.5 -5.0 -7.5 -10.0 - - - - -Male -Female - - -Yes -No - - + + + + + +10 +20 +30 +40 +50 + + + + +2.5 +5.0 +7.5 +10.0 + + +Female +Male + + +No +Yes +2.5 +5.0 +7.5 +10.0 + + + + +Male +Female + + +Yes +No + + upper = c(cont = smooth, combo = box_no_facet, discrete = cross); diag = c(cont = blankDiag, discrete = tableDiag) diff --git a/tests/testthat/_snaps/zzz_ggpairs/ggpairs-smooth-lm-dot-no-facet-crosstable-blankdiag-blankdiag.svg b/tests/testthat/_snaps/zzz_ggpairs/ggpairs-smooth-lm-dot-no-facet-crosstable-blankdiag-blankdiag.svg index 66d384957..fca50edd9 100644 --- a/tests/testthat/_snaps/zzz_ggpairs/ggpairs-smooth-lm-dot-no-facet-crosstable-blankdiag-blankdiag.svg +++ b/tests/testthat/_snaps/zzz_ggpairs/ggpairs-smooth-lm-dot-no-facet-crosstable-blankdiag-blankdiag.svg @@ -21,2928 +21,2928 @@ - 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- + + - - -smoker + + +smoker - - + + - - -total_bill + + +total_bill - - + + - - -tip + + +tip - - + + - - -sex + + +sex - - + + - - -smoker + + +smoker - - - - - -10 -20 -30 -40 -50 - - - - - -0.0 -2.5 -5.0 -7.5 -10.0 - - -Female -Male -2.5 -5.0 -7.5 -10.0 - - - - -0 -5 -10 - - - -0 -5 -10 - - - -0.0 -2.5 -5.0 -7.5 -10.0 -12.5 - - - - - - -0.0 -2.5 -5.0 -7.5 -10.0 -12.5 - - - - - - + + + + + +10 +20 +30 +40 +50 + + + + + +0.0 +2.5 +5.0 +7.5 +10.0 + + +Female +Male +2.5 +5.0 +7.5 +10.0 + + + + +0 +5 +10 + + + +0 +5 +10 + + + +0.0 +2.5 +5.0 +7.5 +10.0 +12.5 + + + + + + +0.0 +2.5 +5.0 +7.5 +10.0 +12.5 + + + + + + upper = c(cont = smooth_loess, combo = ggally_facethist, discrete = facetbar); diag = c(cont = blankDiag, discrete = blankDiag) diff --git a/tests/testthat/_snaps/zzz_ggpairs/show-strips.svg b/tests/testthat/_snaps/zzz_ggpairs/show-strips.svg index 34697ab34..0b8485405 100644 --- a/tests/testthat/_snaps/zzz_ggpairs/show-strips.svg +++ b/tests/testthat/_snaps/zzz_ggpairs/show-strips.svg @@ -364,24 +364,24 @@ - - - + + + - - + + - - + + diff --git a/tests/testthat/test-gg-plots.R b/tests/testthat/test-gg-plots.R index 38389d118..55e411962 100644 --- a/tests/testthat/test-gg-plots.R +++ b/tests/testthat/test-gg-plots.R @@ -24,7 +24,7 @@ test_that("density", { tips, mapping = ggplot2::aes(x = !!as.name("total_bill"), y = !!as.name("tip"), fill = after_stat(level)) ) + ggplot2::scale_fill_gradient(breaks = c(0.05, 0.1, 0.15, 0.2)) - expect_equal(p$labels$fill, "level") + expect_equal(get_labs(p)$fill, "level") }) test_that("cor", { @@ -127,7 +127,7 @@ test_that("dates", { expect_equal(get("aes_params", envir = p$layers[[1]])$label, "Corr:\n0.278***") p <- ggally_barDiag(nas, ggplot2::aes(x = date)) expect_equal(mapping_string(p$mapping$x), "date") - expect_equal(as.character(p$labels$y), "count") + expect_equal(as.character(get_labs(p)$y), "count") }) test_that("cor stars are aligned", { @@ -150,20 +150,20 @@ test_that("ggally_statistic handles factors", { test_that("rescale", { p <- ggally_densityDiag(tips, mapping = ggplot2::aes(x = day), rescale = FALSE) - expect_true(p$labels$y == "density") + expect_true(get_labs(p)$y == "density") vdiffr::expect_doppelganger("rescale-false", p) p <- ggally_densityDiag(tips, mapping = ggplot2::aes(x = day), rescale = TRUE) - expect_true(!identical(p$labels$y, "density")) + expect_true(!identical(get_labs(p)$y, "density")) vdiffr::expect_doppelganger("rescale-true", p) p <- ggally_barDiag(tips, mapping = ggplot2::aes(x = tip), binwidth = 0.25, rescale = FALSE) - expect_true(p$labels$y == "count") + expect_true(get_labs(p)$y == "count") vdiffr::expect_doppelganger("rescale-false-binwidth", p) p <- ggally_barDiag(tips, mapping = ggplot2::aes(x = tip), binwidth = 0.25, rescale = TRUE) - expect_true(!identical(p$labels$y, "count")) + expect_true(!identical(get_labs(p)$y, "count")) vdiffr::expect_doppelganger("rescale-true-binwidth", p) }) diff --git a/tests/testthat/test-ggmatrix_getput.R b/tests/testthat/test-ggmatrix_getput.R index de4a7ad9d..d3035d795 100644 --- a/tests/testthat/test-ggmatrix_getput.R +++ b/tests/testthat/test-ggmatrix_getput.R @@ -31,8 +31,9 @@ test_that("get", { axisLabels = "show" ) p <- a[2, 1] - expect_equal(p$labels$x, "total_bill") - expect_equal(p$labels$y, "tip") + labs <- get_labs(p) + expect_equal(labs$x, "total_bill") + expect_equal(labs$y, "tip") # test odd input and retrieve it a[2, 1] <- 1:4 diff --git a/tests/testthat/test-ggparcoord.R b/tests/testthat/test-ggparcoord.R index 2cf67f8b1..e016d7a67 100644 --- a/tests/testthat/test-ggparcoord.R +++ b/tests/testthat/test-ggparcoord.R @@ -239,7 +239,7 @@ test_that("basic", { # title supplied ttl <- "Parallel Coord. Plot of Diamonds Data" p <- ggparcoord(data = diamonds.samp, columns = c(1, 5:10), title = ttl) - expect_equal(p$labels$title, ttl) + expect_equal(get_labs(p)$title, ttl) col <- "blue" p <- ggparcoord(data = diamonds.samp, columns = c(1, 5:10), shadeBox = col) diff --git a/tests/testthat/test-ggscatmat.R b/tests/testthat/test-ggscatmat.R index 11458ffdd..fb0025a9c 100644 --- a/tests/testthat/test-ggscatmat.R +++ b/tests/testthat/test-ggscatmat.R @@ -6,11 +6,11 @@ test_that("example", { flea2$species2 <- as.character(flea2$species) expect_warning(p <- ggscatmat(flea2, c(1:3)), "Factor variables are omitted in plot") expect_warning(p <- ggscatmat(flea2, c(2:3, 8)), "Factor variables are omitted in plot") - expect_true(is.null(p$labels$colour)) + expect_true(is.null(get_labs(p)$colour)) vdiffr::expect_doppelganger("flea", p) p <- ggscatmat(flea, columns = 2:4, color = "species") - expect_true(!is.null(p$labels$colour)) + expect_true(!is.null(get_labs(p)$colour)) vdiffr::expect_doppelganger("flea-color", p) }) diff --git a/tests/testthat/test-ggsurv.R b/tests/testthat/test-ggsurv.R index 8d14c4b67..281b35653 100644 --- a/tests/testthat/test-ggsurv.R +++ b/tests/testthat/test-ggsurv.R @@ -12,9 +12,10 @@ test_that("single", { expect_equal(mapping_string(a$mapping$x), "time") expect_equal(mapping_string(a$mapping$y), "surv") - expect_true(is.null(a$labels$group)) - expect_true(is.null(a$labels$colour)) - expect_true(is.null(a$labels$linetype)) + labs <- get_labs(a) + expect_true(is.null(labs$group)) + expect_true(is.null(labs$colour)) + expect_true(is.null(labs$linetype)) }) test_that("multiple", { @@ -23,9 +24,10 @@ test_that("multiple", { expect_equal(mapping_string(a$mapping$x), "time") expect_equal(mapping_string(a$mapping$y), "surv") - expect_true(!is.null(a$labels$group)) - expect_true(!is.null(a$labels$colour)) - expect_true(!is.null(a$labels$linetype)) + labs <- get_labs(a) + expect_true(!is.null(labs$group)) + expect_true(!is.null(labs$colour)) + expect_true(!is.null(labs$linetype)) }) test_that("adjust plot", {