Ce fichier est utile pour savoir se retrouver dans mon répertoire de travail.
Tous les dossiers et fichiers importants sont dans /mnt/sdb2/Adama/.
Les dossiers suivant contiennent les modèles.
ModelsGenesis_on_Task502_Lung
ModelsGenesis_on_Task503_Pancreas
TansVW_on_Task502_Lung
TansVW_on_Task503_Pancreas
Le dossier conversion conient les scripts qui permettent la conversion des images de nifti à tiff.
Les configure_docker_for_modelsgenesis contient l'emballage de ModelsGenesis. Il ya une version plus sobre sur github.
Le sossier configure_docker_for_transvw contient tout les scripts que j'ai écrit pour réentrainer le modèle préeentrainé de TransVW. TransVW n'a pas été conteneurisé.
Le dossier nnUNet_trained_models contient le modèle entrainé de nnUNet.
La conteneurisation de nnUNet est dans le dossier nuclei_benchmark/nnUNet/configure_docker_for_nnUNet/