adding data in folders

Author: GNtem2

Hypoxic-Coma/Coma180308.xls

@@ -0,0 +1,40 @@
+Authors,PubYear,StudyYear,metaDuAggregate,metaDu,metaXu,retain,duplicate,CTA6hrs,firstpass,hospital,Country,Study type,total,Quality assessment,Quality assessment182526,Setting ,TP,FP,FN,TN,age,male,id,result_id,study_id,clinical,clinical,HE12,TPMORTSS,FPMORTSS,FNMORTSS,TNMORTSS,TPMORTH,FPMORTH,FNMORTH,TNMORTH,TPMOR30S,FPMOR30S,FNMOR30S,TNMOR30S,TPMOR30H,FPMOR30H,FNMOR30H,TNMOR30H,TPMOR3S,FPMOR3S,FNMOR3S,TNOMOR3S,TPMOR3H,FPMOR3H,FNMOR3H,TNMOR3H,TPPOS,FPPOS,FNPOS,TNPOS,TPPOH,FPPOH,FNPOH,TNPOH,TPGOS,FPGOS,FNGOS,TNGOS,TPGOH,FPGOH,FNGOH,TNGOH,TPMRSS,FPMRSS,FNMRSS,TNMRSS,TPMRSH,FPMRSH,FNMRSH,TNMRSH,TPMRS3S,FPMRS3S,FNMRS3S,TNMRS3S,TPMRS3H,FPMRS3H,FNMRS3H,TNMRS3H,TPMMRSS,FPMMRSS,FNMMRSS,TNMMRSS,TPMMRSH,FPMMRSH,FNMMRSH,TNMMRSH,TPMRSbadS,FPMRSbadS,FNMRSbadS,TNMRSbadS,TPMRSbadH,FPMRSbadH,FNMRSbadH,TNMRSbadH,TPMRSgS,FPMRSgS,FNMRSgS,TNMRSgs,TPMRSgH,FPMRSgH,FNMRSgH,TNMRSgH,TPdiss,FPdiss,FNdiss,TNdiss,TPdisH,FPdisH,FNdisH,TNdisH,TPNS,FPNS,FNNS,TNNS,TPNH,FPNH,FNNH,TNNH,TPdetS,FPdetS,FNdetS,TNdetS,TPdetH,FPdetH,FNdetH,TNdetH,TPevacs,FPevacs,FNevacs,TNevacs,TPevacH,FPevacH,FNevacH,TNevacH,TPexts,FPexts,FNexts,TNexts,TPextH,FPextH,FNextH,TNextH,TPHosps,FPHosps,FNHosps,TNHosps,TPHosph,FPHospH,FNHospH,TNHospH,,retain,duplicate,CTA6hrs,firstpass
+Wada,2007,2004-2006,yes,yes,yes,no,no,yes,yes,Sunnybrook,Canada,Prospective,39,45,40,Single,10,3,1,25,64,26,21,1,21,1,yes,,3,10,14,12,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,9,4,13,13,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,2,11,4,22,,,,,19,,,,,,,,,no,no,yes,yes
+Goldstein,2007,2002-2006,yes,yes,yes,no,yes,no,yes,MGH,US,Retro,104,41,36,Single,13,45,1,45,73,55,37,1,37,1,yes,,19,39,7,39,6,8,20,70,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,48,10,40,6,,,,,,,,,,,,,,no,yes,no,yes
+Delgado Almand,2009,2000-2008,yes,no,yes,yes,yes,no,yes,MGH,US,Retro,367,43,40,Single,14,7,4,36,64,41,35,1,35,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,4,,2,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,15,,12,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,30,,19,,,,,,,yes,yes,no,yes
+Ederies,2009,2004-2008,yes,yes,yes,yes,no,yes,yes,Sunnybrook,Canada,Retro,61,44,37,Single,49,22,6,290,66,214,31,1,31,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,no,yes,yes
+Hallevi,2010,2007-2008,yes,no,no,no,no,yes,no,Texas Houston,US,Prospective,28,46,40,Single,7,10,1,41,61,35,36,1,36,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,3,,2,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,27.8,,14.7,,,,,,,no,no,yes,no
+Park,2010,2007-2009,yes,yes,yes,yes,no,no,yes,Seoul Medical Center,Korea,Prospective,110,42,36,Single,10,9,6,85,62,69,15,1,15,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,8,11,12,79,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,13,3,16,78,,,,,,,,,,,,,,,,,47,,37,,,,,,,yes,no,no,yes
+Evans,2010,2004-2009,yes,yes,yes,yes,no,yes,yes,Sunnybrook,Canada,Retro,59,42,38,Single,11,0,4,12,56.8,,3,1,3,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,no,yes,yes
+Wang,2011,2007-2010,yes,yes,yes,yes,no,yes,yes,Harbin Medical University ,China,Retro,312,40,34,Single,23,7,9,100,55.8,95,11,1,11,1,yes,,6,24,4,105,,,,,,,,,,,,,8,22,8,101,,,,,27,3,76,33,25,7,47,60,,,,,7,25,60,47,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,no,yes,yes
+Li,2011,2007-2010,yes,yes,yes,yes,no,yes,yes,Tiantan,China,Prospective,139,45,39,Single,60,16,17,219,63.9,191,22,1,22,0,no,1,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,no,yes,yes
+Rodriguez-Luna,2011,2009-2010,yes,no,yes,yes,no,yes,yes,Barcelona,Spain,Prospective,133,40,37,Single,5,12,8,64,71.7,77,44,1,44,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,6,11,10,62,,,,,4,13,11,61,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,9,8,9,63,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,no,yes,yes
+Brouwers,2012,2000-2010,yes,yes,yes,yes,yes,yes,yes,MGH,US,Retro,391,36,33,Single,33,41,38,279,71.9,214,26,1,26,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,yes,yes,yes
+Demchuk,2012,2006-2010,yes,yes,yes,yes,yes,yes,yes,Predict,Multiple,Prospective,228,44,41,Multicentre,37,24,36,131,71,130,33,1,33,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,23,38,31,136,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,5,,3,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,yes,yes,yes
+Rosa Junior,2013,2011-2012,yes,no,no,yes,no,no,yes,Sao Paolo,Brazil,Prospective,65,40,34,Single,5,6,3,57,64.3,,18,1,18,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,3,8,30,30,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,no,no,yes
+Sorimachi,2013,2009-2013,no,no,no,no,no,no,yes,Tokai,Japan,Retro,141,43,37,Single,6,13,2,44,,40,8,1,8,1,yes,,14,5,20,26,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,16,3,30,16,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,no,no,no,yes
+Rizos,2013,2008-2011,yes,yes,no,yes,no,yes,yes,Heidelberg,Germany,Prospective,101,45,39,Single,16,11,16,58,,62,16,1,16,1,yes,,7,20,8,66,,,,,,,,,,,,,7,20,17,57,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,4,,4,,,,,,,,,,,,,,5,,4,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,12,15,34,40,,,,,,,,,,,,,,yes,no,yes,yes
+Romero,2013,2009-2010,yes,yes,yes,yes,yes,no,yes,MGH,US,Prospective,131,46,40,Single,16,15,9,91,71.5,79,47,1,47,1,yes,,19,12,9,91,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,28,3,50,50,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,yes,no,yes
+Sun,2013,2009-2010,yes,yes,yes,yes,yes,yes,yes,Tiantan,China,Prospective,112,48,42,Single,17,7,11,77,,72,50,1,50,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,yes,yes,yes
+Huynh,2013,2006-2010,no,no,no,no,yes,yes,yes,Predict,Multiple,Prospective,228,44,41,Single,7,3,3,8,70.4,18,14,1,14,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,5,5,6,5,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,no,yes,yes,yes
+Moon,2014,2005-2012,no,no,yes,yes,no,no,yes,Incheon St. Mary�s Hospital,Korea,Retro,287,42,36,Single,7,8,4,55,70,67,30,1,30,1,yes,1,26,10,22,63,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,6,,4,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,8,7,23,36,,,,,,,,,,,,,,yes,no,no,yes
+Han,2014,2008-2012,no,no,no,yes,no,no,yes,Chonbuk National University ,Korea,Retro,187,44,38,Single,12,1,3,37,54.3,34,6,1,6,0,no,1,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,no,no,yes
+Hotta,2014,2009-2012,yes,yes,yes,yes,no,no,yes,Tokai,Japan,Retro,323,44,38,Single,15,25,29,174,67,187,5,1,5,1,yes,1,17,63,28,135,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,4,76,37,126,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,44,36,117,46,,,,,,,,,,,,,,yes,no,no,yes
+Ciura,2014,2012-2013,no,no,yes,yes,no,no,yes,MGH,US,Prospective,74,45,39,Single,25,15,53,194,62,161,12,1,12,1,yes,,,,,,,,,,8,32,26,221,15,63,19,190,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,5,35,15,232,8,70,12,197,29,11,79,168,44,34,64,145,25,15,103,144,,,,,,,,,,,,,,yes,no,no,yes
+Rodriguez-Luna,2014,2006-2012,yes,no,yes,no,yes,yes,no,Predict,Multiple,Prospective,371,45,42,Single,25,19,2,37,65.7,52,20,1,20,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,no,yes,yes,no
+Ovesen,2014,2011-2012,no,no,yes,yes,no,yes,no,Copenhagen,Denmark,Prospective,25,46,40,Single,26,21,31,238,62,,10,1,10,0,no,1,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,no,yes,no
+Tsukabe,2014,2009-2014,no,no,yes,yes,no,yes,yes,Osaka,Japan,Retro,83,46,40,Single,33,41,123,620,72,456,27,1,27,1,yes,,,,,,70,86,123,538,,,,,,,,,,,,,85,71,159,502,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,no,yes,yes
+Kim,2014,2009-2011,no,no,yes,yes,no,no,yes,Yonsei,Korea,Retro,316,36,30,Single,35,26,12,114,60.45,93,4,1,4,1,yes,,35,26,10,116,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,42,5,79,61,,,,,5,42,61,79,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,53,8,68,58,,,,,8,53,58,68,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,28,33,3,123,,,,,17.89,,16.39,,,,,,,yes,no,no,yes
+Brouwers,2014,1994-2011,yes,yes,yes,no,yes,no,yes,MGH,US,Prospective,817,38,35,Single,37,24,36,131,68.7,129,39,1,39,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,no,yes,no,yes
+Hou,2014,2012-2013,no,no,yes,yes,yes,yes,yes,Tiantan,China,Prospective,53,39,33,Single,44,43,45,188,71,130,45,1,45,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,yes,yes,yes
+Rodriguez-Luna,2016,2006-2010,no,no,yes,no,yes,yes,yes,Predict,Multiple,Prospective,231,45,42,Multicentre,6,10,12,52,68,38,13,1,13,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,15,1,3,61,,,,,8,21,10,41,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,no,yes,yes,yes
+Wang,2016,2014-2015,no,no,yes,yes,no,yes,yes, Zhejiang University,China/US,Retro,72,47,41,Multicentre,10,7,6,100,72,75,48,1,48,1,yes,,7,9,9,98,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,no,yes,yes
+Zheng,2017,2015-2016,no,no,yes,no,yes,yes,yes,Sichuan,China,Retro,115,47,41,Single,16,12,9,78,59,84,25,1,25,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,no,yes,yes,yes
+Orito,2016,2012-2013,no,no,no,yes,no,no,yes,Kurume,Japan,Prospective,80,41,36,Single,20,5,12,35,66,62,23,1,23,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,10,3,22,37,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,no,no,yes
+Morotti ,2016,2001-2015,no,no,yes,yes,yes,no,yes,MGH,US,Retro,709,41,41,Single,32,37,20,103,67,129,42,1,42,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,22,27,49,133,,,,,34,80,37,80,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,12,22,59,138,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,yes,no,yes
+Romero,2017,2009-2012,no,no,yes,no,yes,no,yes,MGH,US,Retro,123,46,42,Single,55,66,67,521,74,396,40,1,40,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,no,yes,no,yes
+Morotti,2017,2011-2015,no,no,no,yes,no,no,yes,Multiple,Multiple,Prospective,133,46,43,Multicentre,13,11,40,69,62,83,7,1,7,0,no,,,,,,,,,,,,,,,,,,30,26,13,54,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,4,7,49,73,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,no,no,yes
+Yu,2017,2015-2016,no,no,yes,yes,yes,yes,yes,Sichuan,China,Retro,129,46,40,Single,19,13,11,86,59,94,49,1,49,0,no,1,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,yes,yes,yes,yes
+nishiyama,2017,2013-2016,no,yes,yes,no,yes,yes,yes,Tokai,Japan,Retro,140,,,Single,10,14,4,112,60,,,,,,,1,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
+boulouis,2016,,no,no,no,yes,yes,yes,yes,MGH,US,Retro,784,,,Single,75,95,81,531,,,,,,,,,100,70,493,119,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
+morotti,2017,,no,no,yes,no,yes,yes,yes,MGH,US,Retro,49,,,Single,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

Spot-Sign/spotsign.Rmd

@@ -0,0 +1,48 @@
+---
+title: "TIAmeta"
+author: "gntem2"
+date: "10/04/2020"
+output: html_document
+---
+
+```{r setup, include=FALSE}
+knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
+```
+
+## R Markdown
+
+This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on using R Markdown see <http://rmarkdown.rstudio.com>.
+
+When you click the **Knit** button a document will be generated that includes both content as well as the output of any embedded R code chunks within the document. You can embed an R code chunk like this:
+
+```{r TIAmeta}
+#TIA project
+#meta-analysis of TIA recurrence at 3 months
+
+#install software from R
+#install.packages("metafor")
+
+#open software metafor
+library(metafor)
+
+dat <- data.frame(model=c("melbourne","paris","oxford","stanford","ottawa","new zealand"),
+xi=c(7,7,6,2,31,2), 
+ni=c(468,296, 281,223,982,172))
+dat$pi <- with(dat, xi/ni)
+dat <- escalc(measure="PFT", xi=xi, ni=ni, data=dat, add=0)	
+res <- rma(yi, vi, method="REML", data=dat, slab=paste(model))
+
+forest(res, transf=transf.ipft.hm, targs=list(ni=dat$ni), xlim=c(-1,1.5),refline=0.020,cex=.8, ilab=cbind(dat$xi, dat$ni),
+       ilab.xpos=c(-.6,-.4),digits=3)
+op <- par(cex=.75, font=2)
+text(-1.0,                7.5, "model ",     pos=4)
+text(c(-.55,-.2), 	7.5, c("recurrence", 	" total subjects"))
+
+text(1.4,                  7.5, "frequency [95% CI]", pos=2)
+par(op)
+
+
+```
+
+
+Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.

Spot-Sign/spotsign.html

@@ -0,0 +1,52 @@
+---
+title: "hint"
+author: "gntem2"
+date: "25/03/2020"
+output: html_document
+---
+
+```{r setup, include=FALSE}
+knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
+```
+
+## R Markdown
+
+This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on using R Markdown see <http://rmarkdown.rstudio.com>.
+
+When you click the **Knit** button a document will be generated that includes both content as well as the output of any embedded R code chunks within the document. You can embed an R code chunk like this:
+
+
+This is a practice run. The data needs to have columns TP, FP, FN, TN. The data comes from study Acad Emerg Med. 2020 Mar 13. doi: 10.1111/acem.13960. It contains findings performed by different types of specialists
+
+```{r data}
+library(tidyverse)
+library(mada)
+
+
+dat<-readxl::read_xlsx("Vertigo_data_SO.xlsx")
+
+#positive likelihood
+posLR.DSL <- madauni(dat, type = "posLR", method = "DSL")
+summary(posLR.DSL)
+forest(posLR.DSL)
+
+#negative likelihood
+negLR.DSL <- madauni(dat, type = "negLR", method = "DSL")
+summary(negLR.DSL)
+forest(negLR.DSL)
+```
+```{r bivariate}
+##bivariate analysis
+
+(ss<-reitsma(dat))
+summary(ss)
+AUC(reitsma(data = dat))
+sumss<-SummaryPts(ss,n.iter = 10^3) #bivariate pooled LR
+summary(sumss)
+
+plot(ss, xlim = c(0,.5), ylim = c(.5,1)) 
+ #    main = "Comparison of Retrospective and Prospective studies") 
+
+```
+
+Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.